37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1674 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1674  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  481  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4723  hypothetical protein  77.45 
 
 		 259 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4123  hypothetical protein  79.49 
 
 		 257 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.40781 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1335  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  74.26 
 
 		 263 aa  362  3e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3193  hypothetical protein  76.52 
 
 		 260 aa  352  4e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1840  hypothetical protein  77.02 
 
 		 260 aa  337  8e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0085031 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2571  hypothetical protein  71.74 
 
 		 259 aa  332  3e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.352522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3649  hypothetical protein  47.59 
 
 		 236 aa  166  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0137828 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0191  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  46.24 
 
 		 236 aa  157  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0876048  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5406  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  41.94 
 
 		 238 aa  149  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3105  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  40 
 
 		 241 aa  138  8.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.163127  normal  0.170192 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2879  hypothetical protein  40 
 
 		 241 aa  138  8.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3002  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  39.5 
 
 		 241 aa  135  8e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3212  hypothetical protein  46.24 
 
 		 256 aa  134  9e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0365  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  42.94 
 
 		 183 aa  122  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0207321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1735  hypothetical protein  36.57 
 
 		 254 aa  97.1  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.9552  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0609  chemotaxis protein  35.33 
 
 		 229 aa  95.1  8e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.147414 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1950  hypothetical protein  36.88 
 
 		 440 aa  95.1  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.309179 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0211  hypothetical protein  32.77 
 
 		 253 aa  92.4  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.730473  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0884  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  35.2 
 
 		 177 aa  87  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156124  hitchhiker  0.002075 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0815  hypothetical protein  38.17 
 
 		 435 aa  85.1  8e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.872238  normal  0.105867 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4931  hypothetical protein  31.34 
 
 		 288 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0889  hypothetical protein  38.06 
 
 		 399 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.135602 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2377  hypothetical protein  35.26 
 
 		 174 aa  84.3  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.388128 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0849  hypothetical protein  38.06 
 
 		 399 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00517849 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4959  hypothetical protein  33.08 
 
 		 294 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.096287  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0418  chemotaxis protein  32.97 
 
 		 178 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.499236  normal  0.280148 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0451  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  32.97 
 
 		 178 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.149721  normal  0.211219 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0488  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  34.1 
 
 		 159 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  0.531435 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2836  hypothetical protein  31.03 
 
 		 259 aa  73.9  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0387  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  34.55 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2224  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  35.33 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.659574  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2148  chemotaxis protein CheZ, putative  27.27 
 
 		 242 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.992761  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1621  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  28.29 
 
 		 248 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27940  chemotaxis regulator CheZ  29.91 
 
 		 226 aa  47  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000139196  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2017  chemotaxis regulator CheZ  34.41 
 
 		 229 aa  46.6  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3028  chemotaxis phosphatase, CheZ  32.91 
 
 		 247 aa  41.6  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>