37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3649 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3649  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  478  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0137828 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0191  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  86.02 
 
 		 236 aa  402  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0876048  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3002  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  56.73 
 
 		 241 aa  278  4e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3105  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  57.26 
 
 		 241 aa  278  7e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.163127  normal  0.170192 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2879  hypothetical protein  57.26 
 
 		 241 aa  278  7e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5406  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  55.23 
 
 		 238 aa  249  3e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3193  hypothetical protein  40.54 
 
 		 260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2571  hypothetical protein  40.86 
 
 		 259 aa  171  6.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.352522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4723  hypothetical protein  41.54 
 
 		 259 aa  171  9e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1674  hypothetical protein  47.31 
 
 		 237 aa  166  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4123  hypothetical protein  39.06 
 
 		 257 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.40781 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1335  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  38.93 
 
 		 263 aa  158  9e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1840  hypothetical protein  38.46 
 
 		 260 aa  158  9e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0085031 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3212  hypothetical protein  42.25 
 
 		 256 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1735  hypothetical protein  38.07 
 
 		 254 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.9552  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0365  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  41.14 
 
 		 183 aa  106  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0207321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4931  hypothetical protein  40.88 
 
 		 288 aa  102  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0849  hypothetical protein  33.17 
 
 		 399 aa  101  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00517849 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0889  hypothetical protein  33.17 
 
 		 399 aa  101  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.135602 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4959  hypothetical protein  39.33 
 
 		 294 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.096287  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0815  hypothetical protein  36.26 
 
 		 435 aa  100  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.872238  normal  0.105867 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1950  hypothetical protein  35.29 
 
 		 440 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.309179 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2377  hypothetical protein  36.93 
 
 		 174 aa  91.3  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.388128 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0211  hypothetical protein  32.97 
 
 		 253 aa  87.8  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.730473  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0609  chemotaxis protein  37.43 
 
 		 229 aa  85.1  9e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.147414 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2836  hypothetical protein  33.88 
 
 		 259 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0884  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  34.91 
 
 		 177 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156124  hitchhiker  0.002075 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0418  chemotaxis protein  36.96 
 
 		 178 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.499236  normal  0.280148 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0451  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  36.96 
 
 		 178 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.149721  normal  0.211219 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0387  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  33.15 
 
 		 196 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0488  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  36.09 
 
 		 159 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  0.531435 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2224  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  30.52 
 
 		 197 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.659574  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0742  chemotaxis regulator CheZ  29.55 
 
 		 220 aa  46.6  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.487627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00955  chemotaxis phosphatase CheZ  28.79 
 
 		 208 aa  43.5  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.417483  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06211  chemotaxis phosphatase CheZ  28.79 
 
 		 208 aa  43.5  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.695232  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0192  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  22.82 
 
 		 186 aa  42.7  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00264382  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0261  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  29.27 
 
 		 248 aa  41.6  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.046719 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>