40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3212 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3212  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  514  1.0000000000000001e-145  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3193  hypothetical protein  41.13 
 
 		 260 aa  142  4e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2571  hypothetical protein  45.98 
 
 		 259 aa  140  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.352522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1335  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  42.63 
 
 		 263 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4723  hypothetical protein  44.89 
 
 		 259 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1674  hypothetical protein  46.24 
 
 		 237 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1840  hypothetical protein  43.75 
 
 		 260 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0085031 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4123  hypothetical protein  38.63 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.40781 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1735  hypothetical protein  37.12 
 
 		 254 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.9552  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3002  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  42.54 
 
 		 241 aa  123  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3105  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  42.54 
 
 		 241 aa  122  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.163127  normal  0.170192 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2879  hypothetical protein  42.54 
 
 		 241 aa  122  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2377  hypothetical protein  39.53 
 
 		 174 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.388128 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0191  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  43.72 
 
 		 236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0876048  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5406  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  39.56 
 
 		 238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3649  hypothetical protein  42.02 
 
 		 236 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0137828 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0211  hypothetical protein  35.33 
 
 		 253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.730473  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0365  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  41.28 
 
 		 183 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0207321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2836  hypothetical protein  35.39 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1950  hypothetical protein  38.17 
 
 		 440 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.309179 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0609  chemotaxis protein  36.36 
 
 		 229 aa  90.5  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.147414 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0889  hypothetical protein  35.92 
 
 		 399 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.135602 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0849  hypothetical protein  35.92 
 
 		 399 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00517849 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0815  hypothetical protein  36.59 
 
 		 435 aa  87  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.872238  normal  0.105867 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0387  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  37.5 
 
 		 196 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0488  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  37.95 
 
 		 159 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  0.531435 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0884  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  34.92 
 
 		 177 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156124  hitchhiker  0.002075 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4931  hypothetical protein  32.54 
 
 		 288 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0418  chemotaxis protein  34.94 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.499236  normal  0.280148 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0451  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  34.94 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.149721  normal  0.211219 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4959  hypothetical protein  31.29 
 
 		 294 aa  82  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.096287  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2224  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  34.55 
 
 		 197 aa  82  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.659574  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0261  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  28.9 
 
 		 248 aa  52  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.046719 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2148  chemotaxis protein CheZ, putative  30.91 
 
 		 242 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.992761  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0389  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  32.32 
 
 		 211 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0037983  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1380  chemotaxis phosphatase, CheZ  29.55 
 
 		 245 aa  45.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.659888  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06211  chemotaxis phosphatase CheZ  28.72 
 
 		 208 aa  43.1  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.695232  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00955  chemotaxis phosphatase CheZ  28.72 
 
 		 208 aa  43.1  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.417483  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3732  hypothetical protein  27.74 
 
 		 121 aa  43.5  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0481  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  27.22 
 
 		 242 aa  42.7  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>