44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4123 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_4123  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  525  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.40781 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1335  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  82.51 
 
 		 263 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1840  hypothetical protein  85.77 
 
 		 260 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0085031 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4723  hypothetical protein  75 
 
 		 259 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1674  hypothetical protein  79.49 
 
 		 237 aa  354  5.999999999999999e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3193  hypothetical protein  68.85 
 
 		 260 aa  345  4e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2571  hypothetical protein  65.25 
 
 		 259 aa  332  2e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.352522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3649  hypothetical protein  39.06 
 
 		 236 aa  162  7e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0137828 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0191  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  45.7 
 
 		 236 aa  155  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0876048  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5406  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  41.8 
 
 		 238 aa  138  8.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2879  hypothetical protein  34.87 
 
 		 241 aa  133  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3105  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  34.87 
 
 		 241 aa  133  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.163127  normal  0.170192 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3002  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  35.36 
 
 		 241 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3212  hypothetical protein  38.63 
 
 		 256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0365  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  42.6 
 
 		 183 aa  123  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0207321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1735  hypothetical protein  37.06 
 
 		 254 aa  103  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.9552  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0211  hypothetical protein  34.55 
 
 		 253 aa  98.6  8e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.730473  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0609  chemotaxis protein  36.09 
 
 		 229 aa  92.8  5e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.147414 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2377  hypothetical protein  37.57 
 
 		 174 aa  87.4  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.388128 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0889  hypothetical protein  39.67 
 
 		 399 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.135602 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0849  hypothetical protein  39.67 
 
 		 399 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00517849 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4931  hypothetical protein  30.6 
 
 		 288 aa  82  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0884  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  34.3 
 
 		 177 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156124  hitchhiker  0.002075 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1950  hypothetical protein  36 
 
 		 440 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.309179 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4959  hypothetical protein  33.8 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.096287  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0815  hypothetical protein  36.64 
 
 		 435 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.872238  normal  0.105867 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0418  chemotaxis protein  30.98 
 
 		 178 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.499236  normal  0.280148 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0451  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  30.98 
 
 		 178 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.149721  normal  0.211219 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2836  hypothetical protein  30 
 
 		 259 aa  72.8  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0488  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  31.98 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  0.531435 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0387  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  31.64 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2224  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  33.13 
 
 		 197 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.659574  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2148  chemotaxis protein CheZ, putative  26.8 
 
 		 242 aa  49.3  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.992761  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3028  chemotaxis phosphatase, CheZ  27.27 
 
 		 247 aa  48.1  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27940  chemotaxis regulator CheZ  32.04 
 
 		 226 aa  48.1  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000139196  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2017  chemotaxis regulator CheZ  32.26 
 
 		 229 aa  46.6  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1621  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  26.62 
 
 		 248 aa  46.2  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5614  chemotaxis regulator CheZ  33.78 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0335696  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02868  chemotaxis protein cheZ  29.47 
 
 		 251 aa  43.9  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0271753  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0261  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  25.5 
 
 		 248 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.046719 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0749  chemotaxis phosphatase, CheZ  37.08 
 
 		 217 aa  42.7  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002834  chemotaxis response - phosphatase CheZ  28.28 
 
 		 246 aa  43.1  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00740148  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3047  chemotaxis phosphatase, CheZ  27.55 
 
 		 245 aa  42.7  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0783794 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0742  chemotaxis regulator CheZ  27.94 
 
 		 220 aa  42  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.487627  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>