80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2148 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2148  chemotaxis protein CheZ, putative  100 
 
 		 242 aa  482  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.992761  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1621  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  55.24 
 
 		 248 aa  274  7e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0261  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  54.03 
 
 		 248 aa  259  2e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.046719 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0481  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  42.92 
 
 		 242 aa  198  7e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0389  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  48.8 
 
 		 211 aa  178  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0037983  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0609  chemotaxis protein  28.21 
 
 		 229 aa  61.6  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.147414 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2803  chemotaxis phosphatase, CheZ  27.78 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.402968  normal  0.192895 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2836  hypothetical protein  33.7 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0749  chemotaxis phosphatase, CheZ  28.99 
 
 		 217 aa  57  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0192  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  26.94 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00264382  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0211  hypothetical protein  38.18 
 
 		 253 aa  54.7  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.730473  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1565  chemotaxis phosphatase, CheZ  24.54 
 
 		 262 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.058559  normal  0.0518536 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0987  chemotaxis phosphatase, CheZ  27.67 
 
 		 253 aa  53.5  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413841 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002834  chemotaxis response - phosphatase CheZ  28.11 
 
 		 246 aa  53.5  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00740148  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00955  chemotaxis phosphatase CheZ  27.27 
 
 		 208 aa  52.8  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.417483  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06211  chemotaxis phosphatase CheZ  27.27 
 
 		 208 aa  52.8  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.695232  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3870  chemotaxis protein CheZ  26.34 
 
 		 262 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.158166  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2288  chemotaxis protein CheZ  33.33 
 
 		 239 aa  52  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45610  chemotaxis protein CheZ  27.32 
 
 		 262 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0109918  normal  0.241564 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4931  hypothetical protein  37.3 
 
 		 288 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0849  hypothetical protein  28.75 
 
 		 399 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00517849 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1973  chemotaxis phosphatase, CheZ  27.06 
 
 		 261 aa  50.8  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1674  hypothetical protein  27.27 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1735  hypothetical protein  33.04 
 
 		 254 aa  50.8  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.9552  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0889  hypothetical protein  28.75 
 
 		 399 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.135602 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3665  chemotaxis phosphatase, CheZ  24.89 
 
 		 262 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00761761  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4339  chemotaxis phosphatase, CheZ  24.22 
 
 		 262 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.297829  normal  0.458128 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1860  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  31.22 
 
 		 201 aa  50.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.339469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3908  chemotaxis phosphatase, CheZ  23.77 
 
 		 262 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.925973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1950  hypothetical protein  29.94 
 
 		 440 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.309179 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2278  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  28.41 
 
 		 245 aa  49.7  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0191817  normal  0.62928 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03142  hypothetical protein  30.43 
 
 		 246 aa  49.3  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4123  hypothetical protein  26.8 
 
 		 257 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.40781 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1652  chemotaxis protein CheZ  25.69 
 
 		 239 aa  48.9  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00206146  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1528  chemotaxis phosphatase, CheZ  25.46 
 
 		 262 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.298774  normal  0.476992 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2557  chemotaxis phosphatase, CheZ  27.23 
 
 		 245 aa  48.9  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.91816  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1385  chemotaxis phosphatase, CheZ  25.82 
 
 		 245 aa  48.1  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00582364  normal  0.177515 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3435  chemotaxis phosphatase, CheZ  23.96 
 
 		 261 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.244587  normal  0.637664 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1840  hypothetical protein  26.8 
 
 		 260 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0085031 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1981  chemotaxis protein CheZ  22.42 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.260664  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3212  hypothetical protein  31.48 
 
 		 256 aa  47.4  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1380  chemotaxis phosphatase, CheZ  25.68 
 
 		 245 aa  47.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.659888  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3193  hypothetical protein  27.74 
 
 		 260 aa  47  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2224  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  28.74 
 
 		 197 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.659574  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1340  chemotaxis phosphatase, CheZ  27.07 
 
 		 258 aa  47  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2571  hypothetical protein  25.33 
 
 		 259 aa  46.6  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.352522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1361  chemotaxis phosphatase, CheZ  27.87 
 
 		 245 aa  45.8  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.349045  normal  0.0601628 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0815  hypothetical protein  30.56 
 
 		 435 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.872238  normal  0.105867 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1301  chemotaxis phosphatase, CheZ  27.87 
 
 		 245 aa  45.8  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.194293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1368  chemotaxis phosphatase, CheZ  27.87 
 
 		 245 aa  45.8  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.724461  normal  0.296544 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2978  chemotaxis regulator CheZ  28.49 
 
 		 214 aa  45.8  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.943723  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3208  chemotaxis protein CheZ  27.87 
 
 		 245 aa  45.8  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4959  hypothetical protein  32.65 
 
 		 294 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.096287  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1401  chemotaxis regulator CheZ  26.36 
 
 		 220 aa  45.4  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.21819  normal  0.433138 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0475  chemotaxis phosphatase, CheZ  25.31 
 
 		 261 aa  44.7  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.51709  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2907  chemotaxis phosphatase, CheZ  26.92 
 
 		 245 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.569265  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2377  hypothetical protein  26.14 
 
 		 174 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.388128 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1335  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  25.68 
 
 		 263 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1345  chemotaxis phosphatase, CheZ  25.57 
 
 		 245 aa  43.9  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0387  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  27.88 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4723  hypothetical protein  30.87 
 
 		 259 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1456  chemotaxis phosphatase, CheZ  26.37 
 
 		 245 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.26387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2917  chemotaxis phosphatase, CheZ  26.92 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3049  chemotaxis phosphatase, CheZ  26.37 
 
 		 245 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.373943 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0601  chemotaxis phosphatase, CheZ  27.01 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2162  chemotaxis protein CheZ  25.87 
 
 		 266 aa  43.5  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1201  chemotaxis phosphatase, CheZ  26.72 
 
 		 245 aa  43.5  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0237799  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3002  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  30.69 
 
 		 241 aa  42.4  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0719  chemotaxis phosphatase, CheZ  24.18 
 
 		 248 aa  42.7  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5406  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  29.81 
 
 		 238 aa  42.7  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3105  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  30.69 
 
 		 241 aa  42.7  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.163127  normal  0.170192 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2879  hypothetical protein  30.69 
 
 		 241 aa  42.7  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4411  chemotaxis phosphatase, CheZ  25.29 
 
 		 214 aa  42.4  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3091  chemotaxis phosphatase, CheZ  28.14 
 
 		 209 aa  42  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27940  chemotaxis regulator CheZ  27.62 
 
 		 226 aa  42  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000139196  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5614  chemotaxis regulator CheZ  28.95 
 
 		 210 aa  42.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0335696  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3028  chemotaxis phosphatase, CheZ  27.27 
 
 		 247 aa  42  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4168  chemotaxis regulator CheZ  27.07 
 
 		 222 aa  42  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4056  chemotaxis regulator CheZ  27.07 
 
 		 222 aa  42  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2875  chemotaxis phosphatase, CheZ  24.59 
 
 		 211 aa  41.6  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.295192  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>