48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0815 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0815  hypothetical protein  100 
 
 		 435 aa  837    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.872238  normal  0.105867 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0889  hypothetical protein  67.04 
 
 		 399 aa  483  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.135602 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0849  hypothetical protein  67.04 
 
 		 399 aa  483  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00517849 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1950  hypothetical protein  45.49 
 
 		 440 aa  278  1e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.309179 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4959  hypothetical protein  58.1 
 
 		 294 aa  253  3e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.096287  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4931  hypothetical protein  52.45 
 
 		 288 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3649  hypothetical protein  36.26 
 
 		 236 aa  101  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0137828 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0191  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  42.98 
 
 		 236 aa  98.2  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0876048  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2489  hypothetical protein  35.96 
 
 		 196 aa  97.4  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0598179  normal  0.0438678 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0211  hypothetical protein  34.73 
 
 		 253 aa  97.1  6e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.730473  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1084  hypothetical protein  40 
 
 		 385 aa  92.8  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.597778  normal  0.461762 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1633  hypothetical protein  38.99 
 
 		 498 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.086496  normal  0.526355 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4488  hypothetical protein  41.4 
 
 		 485 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5560  hypothetical protein  38.36 
 
 		 573 aa  92.4  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.776958 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1624  hypothetical protein  37.66 
 
 		 503 aa  90.1  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.552024  normal  0.642383 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0365  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  38.02 
 
 		 183 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0207321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3212  hypothetical protein  36.59 
 
 		 256 aa  87.4  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1674  hypothetical protein  39.84 
 
 		 237 aa  86.3  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1735  hypothetical protein  37.01 
 
 		 254 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.9552  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4723  hypothetical protein  36.81 
 
 		 259 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1313  hypothetical protein  38.46 
 
 		 379 aa  84.3  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2377  hypothetical protein  32.12 
 
 		 174 aa  84  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.388128 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1335  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  36.11 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3193  hypothetical protein  31.47 
 
 		 260 aa  82.8  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2571  hypothetical protein  33.79 
 
 		 259 aa  82  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.352522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1840  hypothetical protein  36.81 
 
 		 260 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0085031 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2879  hypothetical protein  38.89 
 
 		 241 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3105  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  38.89 
 
 		 241 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.163127  normal  0.170192 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3002  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  38.1 
 
 		 241 aa  80.5  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4123  hypothetical protein  38.21 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.40781 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1449  hypothetical protein  36.54 
 
 		 498 aa  79.7  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0965901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5406  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  31.21 
 
 		 238 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0884  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  38.06 
 
 		 177 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156124  hitchhiker  0.002075 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0609  chemotaxis protein  39.34 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.147414 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2836  hypothetical protein  36.54 
 
 		 259 aa  73.2  0.000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0418  chemotaxis protein  33.11 
 
 		 178 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.499236  normal  0.280148 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0387  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  31.58 
 
 		 196 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0451  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  33.11 
 
 		 178 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.149721  normal  0.211219 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2224  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  33.93 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.659574  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0488  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  31.76 
 
 		 159 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  0.531435 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2148  chemotaxis protein CheZ, putative  28.75 
 
 		 242 aa  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.992761  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0749  chemotaxis phosphatase, CheZ  33.33 
 
 		 217 aa  47.4  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3732  hypothetical protein  29.55 
 
 		 121 aa  45.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06211  chemotaxis phosphatase CheZ  31.91 
 
 		 208 aa  45.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.695232  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00955  chemotaxis phosphatase CheZ  31.91 
 
 		 208 aa  45.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.417483  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0389  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  34.69 
 
 		 211 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0037983  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0481  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  28 
 
 		 242 aa  44.7  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1380  chemotaxis phosphatase, CheZ  37.68 
 
 		 245 aa  43.9  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.659888  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>