37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5406 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5406  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  100 
 
 
238 aa  486  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2879  hypothetical protein  63.49 
 
 
241 aa  308  4e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3105  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  63.49 
 
 
241 aa  308  4e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.163127  normal  0.170192 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3002  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  63.64 
 
 
241 aa  306  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0191  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  56.25 
 
 
236 aa  266  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0876048  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3649  hypothetical protein  55.23 
 
 
236 aa  258  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0137828 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3193  hypothetical protein  43.75 
 
 
260 aa  160  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2571  hypothetical protein  43.39 
 
 
259 aa  156  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.352522  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1674  hypothetical protein  41.94 
 
 
237 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4723  hypothetical protein  36.26 
 
 
259 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1335  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  37.1 
 
 
263 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4123  hypothetical protein  38.08 
 
 
257 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.40781 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1840  hypothetical protein  35.88 
 
 
260 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0085031 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3212  hypothetical protein  39.56 
 
 
256 aa  122  5e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1735  hypothetical protein  32.79 
 
 
254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.9552  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0365  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  36.63 
 
 
183 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0207321  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0211  hypothetical protein  32.96 
 
 
253 aa  94.4  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.730473  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2377  hypothetical protein  34.68 
 
 
174 aa  85.9  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.388128 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4959  hypothetical protein  35.76 
 
 
294 aa  85.1  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.096287  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0889  hypothetical protein  32.57 
 
 
399 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.135602 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0849  hypothetical protein  32.57 
 
 
399 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00517849 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4931  hypothetical protein  35.07 
 
 
288 aa  82  0.000000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154084  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1950  hypothetical protein  33.53 
 
 
440 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.309179 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0815  hypothetical protein  30.06 
 
 
435 aa  79  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.872238  normal  0.105867 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2836  hypothetical protein  32.11 
 
 
259 aa  78.6  0.00000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0884  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  31.11 
 
 
177 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156124  hitchhiker  0.002075 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0609  chemotaxis protein  29.57 
 
 
229 aa  67  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.147414 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0488  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  30.81 
 
 
159 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  0.531435 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0418  chemotaxis protein  30.06 
 
 
178 aa  57  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.499236  normal  0.280148 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0451  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  30.06 
 
 
178 aa  57  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.149721  normal  0.211219 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2224  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  30.81 
 
 
197 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.659574  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0387  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  32.52 
 
 
196 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2148  chemotaxis protein CheZ, putative  28.3 
 
 
242 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.992761  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3521  chemotaxis regulator CheZ  27.65 
 
 
214 aa  43.1  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.328014 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1759  chemotaxis regulator CheZ  27.65 
 
 
214 aa  42.7  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1647  chemotaxis regulator CheZ  27.65 
 
 
214 aa  42.7  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2452  chemotaxis regulator CheZ  32.03 
 
 
214 aa  42.4  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.657615  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>