38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2879 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2879  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  488  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3105  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  100 
 
 		 241 aa  488  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.163127  normal  0.170192 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3002  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  95.85 
 
 		 241 aa  472  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5406  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  63.07 
 
 		 238 aa  288  8e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3649  hypothetical protein  57.26 
 
 		 236 aa  278  8e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0137828 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0191  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  57.2 
 
 		 236 aa  268  5e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0876048  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3193  hypothetical protein  38.87 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2571  hypothetical protein  36.54 
 
 		 259 aa  148  8e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.352522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1335  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  39.56 
 
 		 263 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4723  hypothetical protein  36.5 
 
 		 259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1674  hypothetical protein  40.74 
 
 		 237 aa  137  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4123  hypothetical protein  34.87 
 
 		 257 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.40781 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1840  hypothetical protein  42.53 
 
 		 260 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0085031 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3212  hypothetical protein  42.54 
 
 		 256 aa  124  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1735  hypothetical protein  31.95 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.9552  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0365  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  38.51 
 
 		 183 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0207321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0211  hypothetical protein  37.78 
 
 		 253 aa  99.4  5e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.730473  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2377  hypothetical protein  37.21 
 
 		 174 aa  93.6  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.388128 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4931  hypothetical protein  38.46 
 
 		 288 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1950  hypothetical protein  33.17 
 
 		 440 aa  85.1  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.309179 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0889  hypothetical protein  36.65 
 
 		 399 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.135602 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0849  hypothetical protein  36.65 
 
 		 399 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00517849 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4959  hypothetical protein  38.81 
 
 		 294 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.096287  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2836  hypothetical protein  32.63 
 
 		 259 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0815  hypothetical protein  38.89 
 
 		 435 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.872238  normal  0.105867 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0609  chemotaxis protein  32.81 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.147414 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0884  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  32.75 
 
 		 177 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156124  hitchhiker  0.002075 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0488  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  32.76 
 
 		 159 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  0.531435 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2224  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  32.37 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.659574  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0451  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  32 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.149721  normal  0.211219 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0418  chemotaxis protein  32 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.499236  normal  0.280148 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0387  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  33.95 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0929  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  25.26 
 
 		 186 aa  43.9  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228436  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4056  chemotaxis regulator CheZ  36.47 
 
 		 222 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4168  chemotaxis regulator CheZ  36.47 
 
 		 222 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2148  chemotaxis protein CheZ, putative  30.69 
 
 		 242 aa  42.7  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.992761  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1401  chemotaxis regulator CheZ  35.71 
 
 		 220 aa  42.4  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.21819  normal  0.433138 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0389  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  33.65 
 
 		 211 aa  42  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0037983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>