47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0884 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0884  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  100 
 
 		 177 aa  352  1e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156124  hitchhiker  0.002075 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0451  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  62.07 
 
 		 178 aa  209  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.149721  normal  0.211219 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0418  chemotaxis protein  62.07 
 
 		 178 aa  209  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.499236  normal  0.280148 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0488  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  64.15 
 
 		 159 aa  204  6e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  0.531435 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0387  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  57.41 
 
 		 196 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2224  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  55.15 
 
 		 197 aa  168  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.659574  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0609  chemotaxis protein  48.47 
 
 		 229 aa  134  6.0000000000000005e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.147414 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0365  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  39.52 
 
 		 183 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0207321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4723  hypothetical protein  36.63 
 
 		 259 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2836  hypothetical protein  38.51 
 
 		 259 aa  88.6  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1335  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  36.21 
 
 		 263 aa  88.6  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1674  hypothetical protein  35.2 
 
 		 237 aa  87.4  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1840  hypothetical protein  34.34 
 
 		 260 aa  85.5  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0085031 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3193  hypothetical protein  35 
 
 		 260 aa  84.3  7e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3212  hypothetical protein  34.92 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1735  hypothetical protein  35.5 
 
 		 254 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.9552  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0211  hypothetical protein  33.33 
 
 		 253 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.730473  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4123  hypothetical protein  34.3 
 
 		 257 aa  81.6  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.40781 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2377  hypothetical protein  32.32 
 
 		 174 aa  79  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.388128 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2571  hypothetical protein  33.89 
 
 		 259 aa  79  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.352522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0849  hypothetical protein  36.97 
 
 		 399 aa  74.3  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00517849 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0889  hypothetical protein  36.97 
 
 		 399 aa  74.3  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.135602 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0815  hypothetical protein  38.46 
 
 		 435 aa  74.3  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.872238  normal  0.105867 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0191  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  36.09 
 
 		 236 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0876048  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3649  hypothetical protein  34.91 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0137828 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4959  hypothetical protein  33.62 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.096287  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5406  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  31.11 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3002  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  32.75 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2879  hypothetical protein  32.75 
 
 		 241 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3105  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  32.75 
 
 		 241 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.163127  normal  0.170192 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4931  hypothetical protein  32.76 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1950  hypothetical protein  32.1 
 
 		 440 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.309179 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1385  chemotaxis phosphatase, CheZ  26.7 
 
 		 245 aa  48.1  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00582364  normal  0.177515 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2017  chemotaxis regulator CheZ  32.38 
 
 		 229 aa  46.6  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0749  chemotaxis phosphatase, CheZ  26.53 
 
 		 217 aa  45.4  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2288  chemotaxis protein CheZ  23.74 
 
 		 239 aa  43.9  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1345  chemotaxis phosphatase, CheZ  24.43 
 
 		 245 aa  43.1  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1652  chemotaxis protein CheZ  25.28 
 
 		 239 aa  43.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00206146  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0192  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  24.46 
 
 		 186 aa  43.1  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00264382  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03142  hypothetical protein  24.04 
 
 		 246 aa  42.7  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3426  chemotaxis phosphatase, CheZ  29.35 
 
 		 262 aa  42  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.133495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3732  hypothetical protein  43.75 
 
 		 121 aa  42  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2148  chemotaxis protein CheZ, putative  31.87 
 
 		 242 aa  41.6  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.992761  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1201  chemotaxis phosphatase, CheZ  24.43 
 
 		 245 aa  41.2  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0237799  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1380  chemotaxis phosphatase, CheZ  23.86 
 
 		 245 aa  40.8  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.659888  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1928  chemotaxis phosphatase, CheZ  29.17 
 
 		 221 aa  40.8  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002834  chemotaxis response - phosphatase CheZ  22.95 
 
 		 246 aa  40.8  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00740148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>