48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0889 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0849  hypothetical protein  100 
 
 		 399 aa  770    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00517849 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0889  hypothetical protein  100 
 
 		 399 aa  770    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.135602 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0815  hypothetical protein  87.17 
 
 		 435 aa  427  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.872238  normal  0.105867 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1950  hypothetical protein  57.19 
 
 		 440 aa  277  3e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.309179 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4959  hypothetical protein  57.77 
 
 		 294 aa  248  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.096287  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4931  hypothetical protein  54.55 
 
 		 288 aa  231  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3649  hypothetical protein  33.17 
 
 		 236 aa  101  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0137828 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0191  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  35.37 
 
 		 236 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0876048  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2489  hypothetical protein  36.52 
 
 		 196 aa  95.1  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0598179  normal  0.0438678 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1084  hypothetical protein  34.27 
 
 		 385 aa  94  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.597778  normal  0.461762 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5560  hypothetical protein  38.85 
 
 		 573 aa  93.2  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.776958 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1624  hypothetical protein  36.6 
 
 		 503 aa  92.8  9e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.552024  normal  0.642383 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4488  hypothetical protein  41.67 
 
 		 485 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1633  hypothetical protein  35.98 
 
 		 498 aa  90.9  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.086496  normal  0.526355 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0365  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  42.45 
 
 		 183 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0207321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0211  hypothetical protein  35.5 
 
 		 253 aa  90.1  6e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.730473  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2377  hypothetical protein  32.93 
 
 		 174 aa  90.1  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.388128 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3212  hypothetical protein  35.92 
 
 		 256 aa  87.8  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1840  hypothetical protein  35.26 
 
 		 260 aa  86.3  9e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0085031 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4723  hypothetical protein  35.93 
 
 		 259 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3105  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  36.65 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.163127  normal  0.170192 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2879  hypothetical protein  36.65 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1674  hypothetical protein  38.06 
 
 		 237 aa  83.6  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3002  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  36.02 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5406  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  32.57 
 
 		 238 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4123  hypothetical protein  39.67 
 
 		 257 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.40781 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1735  hypothetical protein  35.26 
 
 		 254 aa  82  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.9552  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1313  hypothetical protein  38.46 
 
 		 379 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1335  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  38.02 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3193  hypothetical protein  32.17 
 
 		 260 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2571  hypothetical protein  32.81 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.352522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0884  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  36.97 
 
 		 177 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156124  hitchhiker  0.002075 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1449  hypothetical protein  31.87 
 
 		 498 aa  73.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0965901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0609  chemotaxis protein  37.82 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.147414 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2836  hypothetical protein  36.51 
 
 		 259 aa  70.5  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0387  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  31.69 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0451  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  36.28 
 
 		 178 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.149721  normal  0.211219 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0418  chemotaxis protein  36.28 
 
 		 178 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.499236  normal  0.280148 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2224  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  33.93 
 
 		 197 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.659574  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00955  chemotaxis phosphatase CheZ  30.17 
 
 		 208 aa  51.6  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.417483  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06211  chemotaxis phosphatase CheZ  30.17 
 
 		 208 aa  51.6  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.695232  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0488  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  32.74 
 
 		 159 aa  52  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  0.531435 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2148  chemotaxis protein CheZ, putative  28.75 
 
 		 242 aa  50.4  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.992761  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0749  chemotaxis phosphatase, CheZ  34.34 
 
 		 217 aa  47  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0192  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  25.84 
 
 		 186 aa  45.4  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00264382  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0389  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  34.69 
 
 		 211 aa  45.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0037983  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3047  chemotaxis phosphatase, CheZ  33.33 
 
 		 245 aa  44.3  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0783794 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1380  chemotaxis phosphatase, CheZ  40.68 
 
 		 245 aa  43.9  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.659888  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>