44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2224 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2224  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  100 
 
 		 197 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.659574  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0387  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  79.29 
 
 		 196 aa  310  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0451  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  60.37 
 
 		 178 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.149721  normal  0.211219 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0418  chemotaxis protein  60.37 
 
 		 178 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.499236  normal  0.280148 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0488  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  60.87 
 
 		 159 aa  192  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  0.531435 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0884  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  55.15 
 
 		 177 aa  168  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156124  hitchhiker  0.002075 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0609  chemotaxis protein  46.58 
 
 		 229 aa  141  5e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.147414 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2836  hypothetical protein  35.86 
 
 		 259 aa  89  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0211  hypothetical protein  34.97 
 
 		 253 aa  87.4  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.730473  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3212  hypothetical protein  34.55 
 
 		 256 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2571  hypothetical protein  35.2 
 
 		 259 aa  81.3  0.000000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.352522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0365  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  36.75 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0207321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3193  hypothetical protein  36.16 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1735  hypothetical protein  34.88 
 
 		 254 aa  74.7  0.0000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.9552  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1335  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  32.93 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1674  hypothetical protein  35.33 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4723  hypothetical protein  34.94 
 
 		 259 aa  72.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1840  hypothetical protein  33.73 
 
 		 260 aa  72  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0085031 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4123  hypothetical protein  33.13 
 
 		 257 aa  71.2  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.40781 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3002  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  33.33 
 
 		 241 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2377  hypothetical protein  30.91 
 
 		 174 aa  64.3  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.388128 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2879  hypothetical protein  32.37 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3105  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  32.37 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.163127  normal  0.170192 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4959  hypothetical protein  32 
 
 		 294 aa  61.6  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.096287  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0849  hypothetical protein  33.93 
 
 		 399 aa  58.2  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00517849 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0889  hypothetical protein  33.93 
 
 		 399 aa  58.2  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.135602 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0815  hypothetical protein  33.93 
 
 		 435 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.872238  normal  0.105867 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4931  hypothetical protein  32.74 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5406  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  30.81 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0191  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  33.94 
 
 		 236 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0876048  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3649  hypothetical protein  30.52 
 
 		 236 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0137828 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1950  hypothetical protein  35.09 
 
 		 440 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.309179 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0481  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  29.8 
 
 		 242 aa  50.1  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0389  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  31.06 
 
 		 211 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0037983  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2148  chemotaxis protein CheZ, putative  28.74 
 
 		 242 aa  46.6  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.992761  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1652  chemotaxis protein CheZ  25.73 
 
 		 239 aa  47  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00206146  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2288  chemotaxis protein CheZ  23.88 
 
 		 239 aa  46.2  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002834  chemotaxis response - phosphatase CheZ  25.61 
 
 		 246 aa  46.2  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00740148  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0192  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  25.81 
 
 		 186 aa  45.8  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00264382  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03142  hypothetical protein  23.79 
 
 		 246 aa  45.8  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3732  hypothetical protein  36.36 
 
 		 121 aa  45.8  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0749  chemotaxis phosphatase, CheZ  32.18 
 
 		 217 aa  45.1  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27940  chemotaxis regulator CheZ  27.98 
 
 		 226 aa  42  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000139196  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2489  hypothetical protein  33.85 
 
 		 196 aa  41.6  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0598179  normal  0.0438678 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>