24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2489 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2489  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  392  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0598179  normal  0.0438678 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4931  hypothetical protein  35.2 
 
 		 288 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0815  hypothetical protein  35.96 
 
 		 435 aa  111  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.872238  normal  0.105867 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4959  hypothetical protein  35.75 
 
 		 294 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.096287  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0849  hypothetical protein  36.52 
 
 		 399 aa  109  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00517849 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0889  hypothetical protein  36.52 
 
 		 399 aa  109  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.135602 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1950  hypothetical protein  34.78 
 
 		 440 aa  101  8e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.309179 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4488  hypothetical protein  28.65 
 
 		 485 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1633  hypothetical protein  31.79 
 
 		 498 aa  58.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.086496  normal  0.526355 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1624  hypothetical protein  33.12 
 
 		 503 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.552024  normal  0.642383 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1084  hypothetical protein  29.86 
 
 		 385 aa  54.7  0.0000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.597778  normal  0.461762 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0211  hypothetical protein  26.77 
 
 		 253 aa  53.9  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.730473  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2377  hypothetical protein  27.27 
 
 		 174 aa  54.3  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.388128 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1449  hypothetical protein  50 
 
 		 498 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0965901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5560  hypothetical protein  31.72 
 
 		 573 aa  52.4  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.776958 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1313  hypothetical protein  48.08 
 
 		 379 aa  52.4  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3649  hypothetical protein  26.09 
 
 		 236 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0137828 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1735  hypothetical protein  31.3 
 
 		 254 aa  45.4  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.9552  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0191  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  26.25 
 
 		 236 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0876048  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3212  hypothetical protein  24.49 
 
 		 256 aa  42.4  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2224  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  29.67 
 
 		 197 aa  41.6  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.659574  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2879  hypothetical protein  28.41 
 
 		 241 aa  41.2  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1335  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  29.55 
 
 		 263 aa  41.2  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3105  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  28.41 
 
 		 241 aa  41.2  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.163127  normal  0.170192 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>