14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4488 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4488  hypothetical protein  100 
 
 		 485 aa  905    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1633  hypothetical protein  45.37 
 
 		 498 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.086496  normal  0.526355 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1624  hypothetical protein  51.44 
 
 		 503 aa  260  4e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.552024  normal  0.642383 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1449  hypothetical protein  63.33 
 
 		 498 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0965901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1084  hypothetical protein  36.68 
 
 		 385 aa  210  4e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.597778  normal  0.461762 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1313  hypothetical protein  37.58 
 
 		 379 aa  189  8e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0889  hypothetical protein  41.67 
 
 		 399 aa  97.4  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.135602 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0849  hypothetical protein  41.67 
 
 		 399 aa  97.4  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00517849 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0815  hypothetical protein  41.4 
 
 		 435 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.872238  normal  0.105867 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4959  hypothetical protein  38.46 
 
 		 294 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.096287  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4931  hypothetical protein  37.11 
 
 		 288 aa  81.3  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1950  hypothetical protein  32.68 
 
 		 440 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.309179 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2489  hypothetical protein  31.79 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0598179  normal  0.0438678 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5560  hypothetical protein  53.85 
 
 		 573 aa  48.5  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.776958 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>