14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1624 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1624  hypothetical protein  100 
 
 		 503 aa  972    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.552024  normal  0.642383 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1633  hypothetical protein  57.79 
 
 		 498 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.086496  normal  0.526355 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4488  hypothetical protein  55.64 
 
 		 485 aa  242  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1449  hypothetical protein  60.34 
 
 		 498 aa  200  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0965901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1313  hypothetical protein  42.57 
 
 		 379 aa  191  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1084  hypothetical protein  48.73 
 
 		 385 aa  179  1e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.597778  normal  0.461762 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0889  hypothetical protein  32.98 
 
 		 399 aa  94  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.135602 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0849  hypothetical protein  32.98 
 
 		 399 aa  94  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00517849 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0815  hypothetical protein  37.66 
 
 		 435 aa  90.1  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.872238  normal  0.105867 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4959  hypothetical protein  39.04 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.096287  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1950  hypothetical protein  31.16 
 
 		 440 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.309179 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4931  hypothetical protein  33.33 
 
 		 288 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2489  hypothetical protein  44.83 
 
 		 196 aa  54.3  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0598179  normal  0.0438678 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5560  hypothetical protein  55.81 
 
 		 573 aa  52  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.776958 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>