14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5560 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5560  hypothetical protein  100 
 
 		 573 aa  1097    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.776958 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1313  hypothetical protein  49.1 
 
 		 379 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1084  hypothetical protein  44.54 
 
 		 385 aa  226  1e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.597778  normal  0.461762 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1624  hypothetical protein  51.46 
 
 		 503 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.552024  normal  0.642383 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1633  hypothetical protein  50.68 
 
 		 498 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.086496  normal  0.526355 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1449  hypothetical protein  51.1 
 
 		 498 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0965901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0889  hypothetical protein  38.85 
 
 		 399 aa  106  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.135602 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0849  hypothetical protein  38.85 
 
 		 399 aa  106  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00517849 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0815  hypothetical protein  39.24 
 
 		 435 aa  101  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.872238  normal  0.105867 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1950  hypothetical protein  36.91 
 
 		 440 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.309179 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4959  hypothetical protein  37.33 
 
 		 294 aa  88.6  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.096287  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4931  hypothetical protein  36.36 
 
 		 288 aa  87  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2489  hypothetical protein  53.49 
 
 		 196 aa  52  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0598179  normal  0.0438678 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3426  hypothetical protein  38.71 
 
 		 370 aa  46.6  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0235657 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>