41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1950 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1950  hypothetical protein  100 
 
 		 440 aa  855    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.309179 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0815  hypothetical protein  42.73 
 
 		 435 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.872238  normal  0.105867 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0849  hypothetical protein  60.25 
 
 		 399 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00517849 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0889  hypothetical protein  60.25 
 
 		 399 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.135602 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4959  hypothetical protein  60.36 
 
 		 294 aa  241  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.096287  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4931  hypothetical protein  59.52 
 
 		 288 aa  230  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3649  hypothetical protein  38.37 
 
 		 236 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0137828 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0191  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  33.33 
 
 		 236 aa  96.7  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0876048  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1674  hypothetical protein  36.88 
 
 		 237 aa  95.5  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2489  hypothetical protein  34.78 
 
 		 196 aa  94.4  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0598179  normal  0.0438678 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3212  hypothetical protein  38.17 
 
 		 256 aa  92.8  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2571  hypothetical protein  35.33 
 
 		 259 aa  90.5  6e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.352522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3193  hypothetical protein  34.13 
 
 		 260 aa  89.7  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1735  hypothetical protein  37.8 
 
 		 254 aa  89.4  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.9552  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4723  hypothetical protein  37.58 
 
 		 259 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0365  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  38.99 
 
 		 183 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0207321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3105  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  33.17 
 
 		 241 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.163127  normal  0.170192 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2879  hypothetical protein  33.17 
 
 		 241 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1840  hypothetical protein  36.5 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0085031 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0211  hypothetical protein  33.85 
 
 		 253 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.730473  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1335  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  33.12 
 
 		 263 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3002  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  32.18 
 
 		 241 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1624  hypothetical protein  30.23 
 
 		 503 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.552024  normal  0.642383 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4123  hypothetical protein  36 
 
 		 257 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.40781 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5406  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  33.53 
 
 		 238 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1084  hypothetical protein  35.26 
 
 		 385 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.597778  normal  0.461762 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2377  hypothetical protein  34.38 
 
 		 174 aa  79  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.388128 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1633  hypothetical protein  33.99 
 
 		 498 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.086496  normal  0.526355 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5560  hypothetical protein  36.24 
 
 		 573 aa  75.5  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.776958 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2836  hypothetical protein  38.79 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4488  hypothetical protein  32.68 
 
 		 485 aa  74.3  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0609  chemotaxis protein  40.17 
 
 		 229 aa  72  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.147414 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1313  hypothetical protein  34.03 
 
 		 379 aa  69.3  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1449  hypothetical protein  33.55 
 
 		 498 aa  68.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0965901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0884  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  32.1 
 
 		 177 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156124  hitchhiker  0.002075 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0387  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  34.45 
 
 		 196 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0418  chemotaxis protein  34.48 
 
 		 178 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.499236  normal  0.280148 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0451  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  34.48 
 
 		 178 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.149721  normal  0.211219 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2224  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  35.09 
 
 		 197 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.659574  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2148  chemotaxis protein CheZ, putative  29.94 
 
 		 242 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.992761  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0488  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  34.82 
 
 		 159 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  0.531435 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>