46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2377 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2377  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  355  1.9999999999999998e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.388128 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3212  hypothetical protein  39.53 
 
 		 256 aa  121  5e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0211  hypothetical protein  36.76 
 
 		 253 aa  118  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.730473  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2571  hypothetical protein  42.44 
 
 		 259 aa  111  6e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.352522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3193  hypothetical protein  40.94 
 
 		 260 aa  107  9.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1735  hypothetical protein  35.71 
 
 		 254 aa  103  9e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.9552  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4723  hypothetical protein  39.53 
 
 		 259 aa  97.8  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0191  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  38.51 
 
 		 236 aa  94  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0876048  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2879  hypothetical protein  37.21 
 
 		 241 aa  93.6  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3105  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  37.21 
 
 		 241 aa  93.6  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.163127  normal  0.170192 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1335  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  36.47 
 
 		 263 aa  92.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0365  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  35.06 
 
 		 183 aa  92  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0207321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3002  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  38.65 
 
 		 241 aa  91.7  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3649  hypothetical protein  36.93 
 
 		 236 aa  91.3  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0137828 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0889  hypothetical protein  32.93 
 
 		 399 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.135602 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0849  hypothetical protein  32.93 
 
 		 399 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00517849 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2836  hypothetical protein  35.14 
 
 		 259 aa  88.6  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1840  hypothetical protein  36.99 
 
 		 260 aa  87.8  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0085031 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4123  hypothetical protein  37.57 
 
 		 257 aa  87.4  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.40781 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5406  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  34.68 
 
 		 238 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4959  hypothetical protein  35.34 
 
 		 294 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.096287  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1674  hypothetical protein  35.26 
 
 		 237 aa  84  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0815  hypothetical protein  36.29 
 
 		 435 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.872238  normal  0.105867 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0884  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  32.32 
 
 		 177 aa  79  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156124  hitchhiker  0.002075 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4931  hypothetical protein  32.82 
 
 		 288 aa  79  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1950  hypothetical protein  32.74 
 
 		 440 aa  78.6  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.309179 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0609  chemotaxis protein  33.14 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.147414 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2224  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  30.91 
 
 		 197 aa  64.3  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.659574  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0488  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  29.27 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  0.531435 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0418  chemotaxis protein  29.34 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.499236  normal  0.280148 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0451  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  29.34 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.149721  normal  0.211219 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0387  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  29.94 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2489  hypothetical protein  32.47 
 
 		 196 aa  52  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0598179  normal  0.0438678 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02868  chemotaxis protein cheZ  26.07 
 
 		 251 aa  48.1  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0271753  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2148  chemotaxis protein CheZ, putative  26.14 
 
 		 242 aa  44.7  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.992761  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1380  chemotaxis phosphatase, CheZ  26.71 
 
 		 245 aa  43.5  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.659888  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2278  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  25.89 
 
 		 245 aa  43.5  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0191817  normal  0.62928 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0749  chemotaxis phosphatase, CheZ  26.67 
 
 		 217 aa  42.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3047  chemotaxis phosphatase, CheZ  24.5 
 
 		 245 aa  42.7  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0783794 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3028  chemotaxis phosphatase, CheZ  32.91 
 
 		 247 aa  42.7  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2288  chemotaxis protein CheZ  32.61 
 
 		 239 aa  42  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002834  chemotaxis response - phosphatase CheZ  25.28 
 
 		 246 aa  42.4  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00740148  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1637  chemotaxis phosphatase, CheZ  30.23 
 
 		 245 aa  42  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2917  chemotaxis phosphatase, CheZ  21.39 
 
 		 245 aa  41.2  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1385  chemotaxis phosphatase, CheZ  21.5 
 
 		 245 aa  40.8  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00582364  normal  0.177515 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2907  chemotaxis phosphatase, CheZ  21.39 
 
 		 245 aa  40.8  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.569265  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>