115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3047 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3047  chemotaxis phosphatase, CheZ  100 
 
 		 245 aa  490  9.999999999999999e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0783794 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1637  chemotaxis phosphatase, CheZ  84.49 
 
 		 245 aa  424  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1385  chemotaxis phosphatase, CheZ  80 
 
 		 245 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00582364  normal  0.177515 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2278  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  78.37 
 
 		 245 aa  390  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0191817  normal  0.62928 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2557  chemotaxis phosphatase, CheZ  76.33 
 
 		 245 aa  384  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.91816  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3208  chemotaxis protein CheZ  75.1 
 
 		 245 aa  381  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1301  chemotaxis phosphatase, CheZ  75.92 
 
 		 245 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.194293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1368  chemotaxis phosphatase, CheZ  75.92 
 
 		 245 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.724461  normal  0.296544 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1361  chemotaxis phosphatase, CheZ  75.92 
 
 		 245 aa  384  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.349045  normal  0.0601628 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1201  chemotaxis phosphatase, CheZ  75.92 
 
 		 245 aa  377  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0237799  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1380  chemotaxis phosphatase, CheZ  76.73 
 
 		 245 aa  380  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.659888  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2907  chemotaxis phosphatase, CheZ  75.51 
 
 		 245 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.569265  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2917  chemotaxis phosphatase, CheZ  74.69 
 
 		 245 aa  374  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3049  chemotaxis phosphatase, CheZ  74.29 
 
 		 245 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.373943 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1456  chemotaxis phosphatase, CheZ  74.29 
 
 		 245 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.26387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1345  chemotaxis phosphatase, CheZ  73.17 
 
 		 245 aa  365  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02868  chemotaxis protein cheZ  56.79 
 
 		 251 aa  268  5e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0271753  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03142  hypothetical protein  54.25 
 
 		 246 aa  246  3e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3028  chemotaxis phosphatase, CheZ  51.25 
 
 		 247 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1652  chemotaxis protein CheZ  52.72 
 
 		 239 aa  242  3e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00206146  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002834  chemotaxis response - phosphatase CheZ  52.44 
 
 		 246 aa  239  2.9999999999999997e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00740148  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1521  chemotaxis protein CheZ  51.85 
 
 		 243 aa  229  3e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2288  chemotaxis protein CheZ  48.95 
 
 		 239 aa  229  3e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45610  chemotaxis protein CheZ  43.72 
 
 		 262 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0109918  normal  0.241564 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0987  chemotaxis phosphatase, CheZ  43.98 
 
 		 253 aa  194  1e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413841 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2803  chemotaxis phosphatase, CheZ  43.85 
 
 		 262 aa  193  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.402968  normal  0.192895 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3870  chemotaxis protein CheZ  42.91 
 
 		 262 aa  193  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.158166  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1177  chemotaxis phosphatase, CheZ  40.8 
 
 		 258 aa  192  4e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.169266  normal  0.394686 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3435  chemotaxis phosphatase, CheZ  42.04 
 
 		 261 aa  191  8e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.244587  normal  0.637664 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0475  chemotaxis phosphatase, CheZ  43.85 
 
 		 261 aa  190  2e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.51709  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1565  chemotaxis phosphatase, CheZ  42.51 
 
 		 262 aa  188  8e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.058559  normal  0.0518536 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1340  chemotaxis phosphatase, CheZ  42.56 
 
 		 258 aa  186  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1981  chemotaxis protein CheZ  43.42 
 
 		 228 aa  185  7e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.260664  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2162  chemotaxis protein CheZ  43.5 
 
 		 266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3665  chemotaxis phosphatase, CheZ  41.87 
 
 		 262 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00761761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1973  chemotaxis phosphatase, CheZ  43.57 
 
 		 261 aa  179  4.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1528  chemotaxis phosphatase, CheZ  41.87 
 
 		 262 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.298774  normal  0.476992 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4339  chemotaxis phosphatase, CheZ  41.87 
 
 		 262 aa  178  7e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.297829  normal  0.458128 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3908  chemotaxis phosphatase, CheZ  41.87 
 
 		 262 aa  178  7e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.925973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3426  chemotaxis phosphatase, CheZ  38.85 
 
 		 262 aa  161  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.133495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0719  chemotaxis phosphatase, CheZ  32.64 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0737  chemotaxis regulator CheZ  36.19 
 
 		 236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3695  chemotaxis regulator CheZ  35.78 
 
 		 211 aa  126  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0568116  normal  0.0208475 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2017  chemotaxis regulator CheZ  34.98 
 
 		 229 aa  125  9e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0742  chemotaxis regulator CheZ  36 
 
 		 220 aa  124  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.487627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5614  chemotaxis regulator CheZ  35.78 
 
 		 210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0335696  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4168  chemotaxis regulator CheZ  34.96 
 
 		 222 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4056  chemotaxis regulator CheZ  34.96 
 
 		 222 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3705  chemotaxis phosphatase, CheZ  38.16 
 
 		 215 aa  118  7e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.524625  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1401  chemotaxis regulator CheZ  33.33 
 
 		 220 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.21819  normal  0.433138 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1928  chemotaxis phosphatase, CheZ  34.98 
 
 		 221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1546  chemotaxis regulator CheZ  35.58 
 
 		 214 aa  116  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0126  chemotaxis regulator CheZ  32.61 
 
 		 236 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4150  chemotaxis phosphatase, CheZ  33.5 
 
 		 218 aa  115  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.667805  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2978  chemotaxis regulator CheZ  36.82 
 
 		 214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.943723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2967  chemotaxis regulator CheZ  32.46 
 
 		 239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00162483 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3807  chemotaxis regulator CheZ  33.81 
 
 		 236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2605  chemotaxis regulator CheZ  35.78 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3222  chemotaxis regulator CheZ  33.66 
 
 		 284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504893  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1861  chemotaxis regulator CheZ  35.78 
 
 		 214 aa  113  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3175  chemotaxis regulator CheZ  34.2 
 
 		 242 aa  112  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2844  chemotaxis regulator CheZ  33.02 
 
 		 243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157471  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0263  chemotaxis regulator CheZ  33.02 
 
 		 243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.963911  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0245  chemotaxis regulator CheZ  33.02 
 
 		 243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.514565  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2851  chemotaxis regulator CheZ  33.77 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0069  chemotaxis regulator CheZ  33.77 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3091  chemotaxis phosphatase, CheZ  36.1 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3427  chemotaxis regulator CheZ  33.77 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1691  chemotaxis regulator CheZ  33.77 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3848  chemotaxis regulator CheZ  33.77 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3929  chemotaxis regulator CheZ  33.77 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0936749  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3124  chemotaxis regulator CheZ  33.77 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.853888  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2452  chemotaxis regulator CheZ  35.35 
 
 		 214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.657615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3365  chemotaxis regulator CheZ  33.02 
 
 		 243 aa  108  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00227923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0172  chemotaxis regulator CheZ  34.43 
 
 		 243 aa  108  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110487  normal  0.375463 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27940  chemotaxis regulator CheZ  32.56 
 
 		 226 aa  108  7.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000139196  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2875  chemotaxis phosphatase, CheZ  36.27 
 
 		 211 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.295192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1518  chemotaxis regulator CheZ  35.1 
 
 		 214 aa  108  9.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3521  chemotaxis regulator CheZ  34.62 
 
 		 214 aa  108  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.328014 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1647  chemotaxis regulator CheZ  34.62 
 
 		 214 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1759  chemotaxis regulator CheZ  34.62 
 
 		 214 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0189  chemotaxis regulator CheZ  32.56 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01852  chemotaxis regulator, protein phosphatase for CheY  34.34 
 
 		 214 aa  106  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.850509  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1759  chemotaxis phosphatase, CheZ  34.34 
 
 		 214 aa  106  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.414683  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0176  chemotaxis regulator CheZ  32.56 
 
 		 243 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.72153  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1977  chemotaxis regulator CheZ  34.34 
 
 		 214 aa  106  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2114  chemotaxis regulator CheZ  34.34 
 
 		 214 aa  106  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.636511  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1751  chemotaxis regulator CheZ  34.34 
 
 		 214 aa  106  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1303  chemotaxis regulator CheZ  34.34 
 
 		 214 aa  106  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238575 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01841  hypothetical protein  34.34 
 
 		 214 aa  106  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.64287  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0998  chemotaxis phosphatase, CheZ  33.5 
 
 		 210 aa  105  5e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2070  chemotaxis regulator CheZ  36.27 
 
 		 214 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492059 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1207  chemotaxis regulator CheZ  36.27 
 
 		 214 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3818  chemotaxis phosphatase, CheZ  34.48 
 
 		 209 aa  105  6e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.391549 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2075  chemotaxis regulator CheZ  35.68 
 
 		 214 aa  105  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000441375 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2130  chemotaxis regulator CheZ  35.68 
 
 		 214 aa  105  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000301905 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1330  chemotaxis regulator CheZ  35.68 
 
 		 214 aa  105  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000240713 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1613  chemotaxis regulator CheZ  33.5 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0936908 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0601  chemotaxis phosphatase, CheZ  34.5 
 
 		 204 aa  104  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2619  chemotaxis regulator CheZ  33.84 
 
 		 214 aa  104  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000452679 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>