56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0488 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0488  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  100 
 
 		 159 aa  317  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  0.531435 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0418  chemotaxis protein  94.34 
 
 		 178 aa  305  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.499236  normal  0.280148 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0451  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  94.34 
 
 		 178 aa  305  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.149721  normal  0.211219 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0884  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  64.15 
 
 		 177 aa  204  4e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156124  hitchhiker  0.002075 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2224  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  60.87 
 
 		 197 aa  192  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.659574  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0387  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  60.25 
 
 		 196 aa  186  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0609  chemotaxis protein  46.58 
 
 		 229 aa  138  3e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.147414 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3212  hypothetical protein  37.95 
 
 		 256 aa  86.3  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0365  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  37.13 
 
 		 183 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0207321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2836  hypothetical protein  35.06 
 
 		 259 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1674  hypothetical protein  34.1 
 
 		 237 aa  75.1  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3193  hypothetical protein  33.91 
 
 		 260 aa  75.1  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0211  hypothetical protein  31.03 
 
 		 253 aa  74.7  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.730473  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4723  hypothetical protein  34.3 
 
 		 259 aa  74.3  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1840  hypothetical protein  32.56 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0085031 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4123  hypothetical protein  31.98 
 
 		 257 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.40781 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2571  hypothetical protein  33.93 
 
 		 259 aa  72.8  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.352522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1335  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  32.37 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1735  hypothetical protein  32.14 
 
 		 254 aa  68.2  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.9552  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3002  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  32.76 
 
 		 241 aa  63.9  0.0000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3105  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  32.76 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.163127  normal  0.170192 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2879  hypothetical protein  32.76 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2377  hypothetical protein  29.27 
 
 		 174 aa  60.8  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.388128 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5406  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  30.81 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0191  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  34.78 
 
 		 236 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0876048  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4959  hypothetical protein  31.3 
 
 		 294 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.096287  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0815  hypothetical protein  32.74 
 
 		 435 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.872238  normal  0.105867 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3649  hypothetical protein  36.09 
 
 		 236 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0137828 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0889  hypothetical protein  33.63 
 
 		 399 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.135602 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0849  hypothetical protein  33.63 
 
 		 399 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00517849 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1950  hypothetical protein  34.82 
 
 		 440 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.309179 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4931  hypothetical protein  30.43 
 
 		 288 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1928  chemotaxis phosphatase, CheZ  34.48 
 
 		 221 aa  48.5  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2070  chemotaxis regulator CheZ  33.33 
 
 		 214 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492059 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1207  chemotaxis regulator CheZ  33.33 
 
 		 214 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1330  chemotaxis regulator CheZ  33.33 
 
 		 214 aa  48.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000240713 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2130  chemotaxis regulator CheZ  33.33 
 
 		 214 aa  48.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000301905 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2075  chemotaxis regulator CheZ  33.33 
 
 		 214 aa  48.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000441375 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3732  hypothetical protein  35.78 
 
 		 121 aa  46.6  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2452  chemotaxis regulator CheZ  31 
 
 		 214 aa  45.1  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.657615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2619  chemotaxis regulator CheZ  30 
 
 		 214 aa  44.3  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000452679 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01841  hypothetical protein  30 
 
 		 214 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.64287  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1759  chemotaxis phosphatase, CheZ  30 
 
 		 214 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.414683  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1303  chemotaxis regulator CheZ  30 
 
 		 214 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238575 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1751  chemotaxis regulator CheZ  30 
 
 		 214 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2114  chemotaxis regulator CheZ  30 
 
 		 214 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.636511  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1977  chemotaxis regulator CheZ  30 
 
 		 214 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01852  chemotaxis regulator, protein phosphatase for CheY  30 
 
 		 214 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.850509  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2017  chemotaxis regulator CheZ  32.08 
 
 		 229 aa  43.5  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4150  chemotaxis phosphatase, CheZ  30 
 
 		 218 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.667805  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1546  chemotaxis regulator CheZ  30.21 
 
 		 214 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3695  chemotaxis regulator CheZ  32.35 
 
 		 211 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0568116  normal  0.0208475 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0192  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  25.68 
 
 		 186 aa  40.8  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00264382  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2288  chemotaxis protein CheZ  27.17 
 
 		 239 aa  40.8  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0261  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  27.33 
 
 		 248 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.046719 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1518  chemotaxis regulator CheZ  28.45 
 
 		 214 aa  40.4  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>