67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0192 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0192  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  100 
 
 
186 aa  359  1e-98  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00264382  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0929  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  47.28 
 
 
186 aa  151  5e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228436  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0987  chemotaxis phosphatase, CheZ  28.5 
 
 
253 aa  64.3  0.0000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.413841 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0481  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  26.67 
 
 
242 aa  57  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2148  chemotaxis protein CheZ, putative  26.94 
 
 
242 aa  55.1  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.992761  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27940  chemotaxis regulator CheZ  25.53 
 
 
226 aa  54.7  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000139196  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2836  hypothetical protein  24.24 
 
 
259 aa  53.9  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4150  chemotaxis phosphatase, CheZ  23.41 
 
 
218 aa  52  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.667805  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1546  chemotaxis regulator CheZ  25.41 
 
 
214 aa  51.2  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0261  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  26.22 
 
 
248 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.046719 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1345  chemotaxis phosphatase, CheZ  25.48 
 
 
245 aa  50.1  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4056  chemotaxis regulator CheZ  22.78 
 
 
222 aa  49.3  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4168  chemotaxis regulator CheZ  22.78 
 
 
222 aa  49.3  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1652  chemotaxis protein CheZ  29.14 
 
 
239 aa  48.9  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00206146  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1385  chemotaxis phosphatase, CheZ  24.27 
 
 
245 aa  48.9  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00582364  normal  0.177515 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0737  chemotaxis regulator CheZ  24.71 
 
 
236 aa  48.5  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2288  chemotaxis protein CheZ  27.12 
 
 
239 aa  47  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1401  chemotaxis regulator CheZ  22.16 
 
 
220 aa  47  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.21819  normal  0.433138 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2605  chemotaxis regulator CheZ  23.26 
 
 
214 aa  45.8  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2017  chemotaxis regulator CheZ  23.94 
 
 
229 aa  45.8  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3028  chemotaxis phosphatase, CheZ  26.48 
 
 
247 aa  46.2  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2224  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  25.81 
 
 
197 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.659574  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00955  chemotaxis phosphatase CheZ  24.05 
 
 
208 aa  46.2  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.417483  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5614  chemotaxis regulator CheZ  23.22 
 
 
210 aa  45.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0335696  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06211  chemotaxis phosphatase CheZ  24.05 
 
 
208 aa  46.2  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.695232  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1621  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  26.88 
 
 
248 aa  45.8  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0849  hypothetical protein  25.84 
 
 
399 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00517849 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0889  hypothetical protein  25.84 
 
 
399 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.135602 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0475  chemotaxis phosphatase, CheZ  22.69 
 
 
261 aa  45.4  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.51709  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1201  chemotaxis phosphatase, CheZ  27.54 
 
 
245 aa  45.4  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0237799  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1177  chemotaxis phosphatase, CheZ  28.57 
 
 
258 aa  45.1  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.169266  normal  0.394686 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0742  chemotaxis regulator CheZ  23.78 
 
 
220 aa  45.1  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.487627  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1981  chemotaxis protein CheZ  23.32 
 
 
228 aa  44.7  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.260664  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1340  chemotaxis phosphatase, CheZ  23.33 
 
 
258 aa  43.9  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1861  chemotaxis regulator CheZ  22.67 
 
 
214 aa  44.3  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0389  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  26.55 
 
 
211 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0037983  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3435  chemotaxis phosphatase, CheZ  23.32 
 
 
261 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.244587  normal  0.637664 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1735  hypothetical protein  25.82 
 
 
254 aa  43.5  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.9552  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0451  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  25.54 
 
 
178 aa  43.5  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.149721  normal  0.211219 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02868  chemotaxis protein cheZ  29.89 
 
 
251 aa  43.1  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0271753  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0774  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  25.47 
 
 
336 aa  43.5  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0592976  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0191  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  26.47 
 
 
236 aa  43.5  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0876048  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0418  chemotaxis protein  25.54 
 
 
178 aa  43.5  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.499236  normal  0.280148 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2967  chemotaxis regulator CheZ  20.62 
 
 
239 aa  43.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00162483 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0884  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  24.46 
 
 
177 aa  43.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156124  hitchhiker  0.002075 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0387  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  26.24 
 
 
196 aa  42.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0126  chemotaxis regulator CheZ  22.28 
 
 
236 aa  42.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3649  hypothetical protein  22.82 
 
 
236 aa  42.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0137828 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1973  chemotaxis phosphatase, CheZ  25.47 
 
 
261 aa  43.1  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1637  chemotaxis phosphatase, CheZ  27.53 
 
 
245 aa  42.4  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2907  chemotaxis phosphatase, CheZ  25 
 
 
245 aa  42.4  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.569265  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3695  chemotaxis regulator CheZ  21.7 
 
 
211 aa  42  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0568116  normal  0.0208475 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2619  chemotaxis regulator CheZ  30.95 
 
 
214 aa  42  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000452679 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1759  chemotaxis phosphatase, CheZ  30.95 
 
 
214 aa  41.6  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.414683  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1977  chemotaxis regulator CheZ  30.95 
 
 
214 aa  41.6  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2114  chemotaxis regulator CheZ  30.95 
 
 
214 aa  41.6  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.636511  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01841  hypothetical protein  30.95 
 
 
214 aa  41.6  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.64287  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1751  chemotaxis regulator CheZ  30.95 
 
 
214 aa  41.6  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1303  chemotaxis regulator CheZ  30.95 
 
 
214 aa  41.6  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238575 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01852  chemotaxis regulator, protein phosphatase for CheY  30.95 
 
 
214 aa  41.6  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.850509  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2879  hypothetical protein  27.88 
 
 
241 aa  41.6  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1521  chemotaxis protein CheZ  26.82 
 
 
243 aa  41.6  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3105  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  27.88 
 
 
241 aa  41.6  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.163127  normal  0.170192 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3807  chemotaxis regulator CheZ  21.69 
 
 
236 aa  41.6  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1335  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  28.57 
 
 
263 aa  41.6  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1518  chemotaxis regulator CheZ  22.89 
 
 
214 aa  40.8  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0815  hypothetical protein  24.63 
 
 
435 aa  40.8  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.872238  normal  0.105867 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>