68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0261 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0261  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  100 
 
 		 248 aa  482  1e-135  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.046719 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1621  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  58.47 
 
 		 248 aa  290  2e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2148  chemotaxis protein CheZ, putative  54.03 
 
 		 242 aa  259  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.992761  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0481  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  44.49 
 
 		 242 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0389  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  43.26 
 
 		 211 aa  167  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0037983  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0211  hypothetical protein  30 
 
 		 253 aa  58.5  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.730473  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3212  hypothetical protein  28.65 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0192  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  26.22 
 
 		 186 aa  50.4  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00264382  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2278  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  35.51 
 
 		 245 aa  48.9  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0191817  normal  0.62928 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4056  chemotaxis regulator CheZ  40.21 
 
 		 222 aa  48.9  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4168  chemotaxis regulator CheZ  40.21 
 
 		 222 aa  48.9  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1201  chemotaxis phosphatase, CheZ  37.63 
 
 		 245 aa  48.1  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0237799  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2162  chemotaxis protein CheZ  28.43 
 
 		 266 aa  48.5  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1345  chemotaxis phosphatase, CheZ  28.32 
 
 		 245 aa  48.5  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2803  chemotaxis phosphatase, CheZ  27.37 
 
 		 262 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.402968  normal  0.192895 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0601  chemotaxis phosphatase, CheZ  29.94 
 
 		 204 aa  47  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1637  chemotaxis phosphatase, CheZ  30.41 
 
 		 245 aa  47  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1401  chemotaxis regulator CheZ  39.58 
 
 		 220 aa  47  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.21819  normal  0.433138 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5614  chemotaxis regulator CheZ  34 
 
 		 210 aa  47  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0335696  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27940  chemotaxis regulator CheZ  36.08 
 
 		 226 aa  46.6  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000139196  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1973  chemotaxis phosphatase, CheZ  34.95 
 
 		 261 aa  46.2  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2017  chemotaxis regulator CheZ  35.64 
 
 		 229 aa  46.2  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3695  chemotaxis regulator CheZ  37.89 
 
 		 211 aa  46.2  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0568116  normal  0.0208475 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0749  chemotaxis phosphatase, CheZ  28.22 
 
 		 217 aa  46.2  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1861  chemotaxis regulator CheZ  29.21 
 
 		 214 aa  45.8  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1385  chemotaxis phosphatase, CheZ  25.7 
 
 		 245 aa  45.8  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00582364  normal  0.177515 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00955  chemotaxis phosphatase CheZ  29.48 
 
 		 208 aa  45.8  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.417483  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4150  chemotaxis phosphatase, CheZ  33.71 
 
 		 218 aa  45.8  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.667805  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06211  chemotaxis phosphatase CheZ  29.48 
 
 		 208 aa  45.8  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.695232  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3091  chemotaxis phosphatase, CheZ  33.98 
 
 		 209 aa  45.4  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2605  chemotaxis regulator CheZ  28.65 
 
 		 214 aa  45.4  0.0009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02868  chemotaxis protein cheZ  26.82 
 
 		 251 aa  45.4  0.0009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0271753  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0451  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  29.33 
 
 		 178 aa  45.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.149721  normal  0.211219 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0418  chemotaxis protein  29.33 
 
 		 178 aa  45.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.499236  normal  0.280148 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2907  chemotaxis phosphatase, CheZ  30.11 
 
 		 245 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.569265  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1456  chemotaxis phosphatase, CheZ  28.98 
 
 		 245 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.26387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2917  chemotaxis phosphatase, CheZ  28.98 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0742  chemotaxis regulator CheZ  32.48 
 
 		 220 aa  44.3  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.487627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3665  chemotaxis phosphatase, CheZ  31.4 
 
 		 262 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00761761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1528  chemotaxis phosphatase, CheZ  29.57 
 
 		 262 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.298774  normal  0.476992 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1335  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  26.36 
 
 		 263 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3047  chemotaxis phosphatase, CheZ  27.62 
 
 		 245 aa  43.5  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0783794 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1380  chemotaxis phosphatase, CheZ  29.57 
 
 		 245 aa  43.5  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.659888  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2836  hypothetical protein  32.46 
 
 		 259 aa  43.5  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4959  hypothetical protein  32.19 
 
 		 294 aa  43.5  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.096287  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3870  chemotaxis protein CheZ  33.33 
 
 		 262 aa  43.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.158166  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3208  chemotaxis protein CheZ  38.78 
 
 		 245 aa  43.5  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3435  chemotaxis phosphatase, CheZ  32.71 
 
 		 261 aa  43.5  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.244587  normal  0.637664 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03142  hypothetical protein  34.96 
 
 		 246 aa  43.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1840  hypothetical protein  25 
 
 		 260 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0085031 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3818  chemotaxis phosphatase, CheZ  33.98 
 
 		 209 aa  43.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.391549 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1361  chemotaxis phosphatase, CheZ  38.78 
 
 		 245 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.349045  normal  0.0601628 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4123  hypothetical protein  25.5 
 
 		 257 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.40781 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1301  chemotaxis phosphatase, CheZ  38.78 
 
 		 245 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.194293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1368  chemotaxis phosphatase, CheZ  38.78 
 
 		 245 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.724461  normal  0.296544 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3049  chemotaxis phosphatase, CheZ  28.41 
 
 		 245 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.373943 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1565  chemotaxis phosphatase, CheZ  29.57 
 
 		 262 aa  42.7  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.058559  normal  0.0518536 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3908  chemotaxis phosphatase, CheZ  28.7 
 
 		 262 aa  42.4  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.925973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4931  hypothetical protein  34.31 
 
 		 288 aa  42.4  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0849  hypothetical protein  31.37 
 
 		 399 aa  42  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00517849 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1652  chemotaxis protein CheZ  34.02 
 
 		 239 aa  42  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00206146  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0737  chemotaxis regulator CheZ  36.08 
 
 		 236 aa  42  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0889  hypothetical protein  31.37 
 
 		 399 aa  42  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.135602 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002834  chemotaxis response - phosphatase CheZ  32.82 
 
 		 246 aa  42  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00740148  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45610  chemotaxis protein CheZ  29.51 
 
 		 262 aa  42  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0109918  normal  0.241564 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1340  chemotaxis phosphatase, CheZ  26.26 
 
 		 258 aa  42  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1928  chemotaxis phosphatase, CheZ  27.93 
 
 		 221 aa  42  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4339  chemotaxis phosphatase, CheZ  28.7 
 
 		 262 aa  42  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.297829  normal  0.458128 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>