109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0601 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_0601  chemotaxis phosphatase, CheZ  100 
 
 
204 aa  410  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3091  chemotaxis phosphatase, CheZ  71 
 
 
209 aa  277  8e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4411  chemotaxis phosphatase, CheZ  69.63 
 
 
214 aa  277  1e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3818  chemotaxis phosphatase, CheZ  70 
 
 
209 aa  266  1e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.391549 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3705  chemotaxis phosphatase, CheZ  64.88 
 
 
215 aa  259  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.524625  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4424  chemotaxis phosphatase, CheZ  69.7 
 
 
207 aa  255  4e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.756702  normal  0.618914 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2875  chemotaxis phosphatase, CheZ  52.63 
 
 
211 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.295192  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0998  chemotaxis phosphatase, CheZ  52.82 
 
 
210 aa  195  4.0000000000000005e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3695  chemotaxis regulator CheZ  41.67 
 
 
211 aa  141  7e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0568116  normal  0.0208475 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1928  chemotaxis phosphatase, CheZ  40.49 
 
 
221 aa  135  5e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0737  chemotaxis regulator CheZ  40.58 
 
 
236 aa  134  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2017  chemotaxis regulator CheZ  42.99 
 
 
229 aa  134  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5614  chemotaxis regulator CheZ  39.61 
 
 
210 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0335696  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3222  chemotaxis regulator CheZ  42.03 
 
 
284 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504893  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0172  chemotaxis regulator CheZ  38.89 
 
 
243 aa  128  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110487  normal  0.375463 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27940  chemotaxis regulator CheZ  41.86 
 
 
226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000139196  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1401  chemotaxis regulator CheZ  39.9 
 
 
220 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.21819  normal  0.433138 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2967  chemotaxis regulator CheZ  37.27 
 
 
239 aa  124  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00162483 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4056  chemotaxis regulator CheZ  37.98 
 
 
222 aa  124  7e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1546  chemotaxis regulator CheZ  38.65 
 
 
214 aa  124  7e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4168  chemotaxis regulator CheZ  37.98 
 
 
222 aa  124  7e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0742  chemotaxis regulator CheZ  39.32 
 
 
220 aa  124  8.000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.487627  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2844  chemotaxis regulator CheZ  36.57 
 
 
243 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157471  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0263  chemotaxis regulator CheZ  36.57 
 
 
243 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.963911  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0245  chemotaxis regulator CheZ  36.57 
 
 
243 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.514565  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3807  chemotaxis regulator CheZ  37.21 
 
 
236 aa  123  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0189  chemotaxis regulator CheZ  35.19 
 
 
243 aa  122  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2452  chemotaxis regulator CheZ  37.07 
 
 
214 aa  122  4e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.657615  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0126  chemotaxis regulator CheZ  36.74 
 
 
236 aa  122  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3365  chemotaxis regulator CheZ  36.11 
 
 
243 aa  121  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00227923  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3175  chemotaxis regulator CheZ  35.65 
 
 
242 aa  121  8e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2851  chemotaxis regulator CheZ  35.65 
 
 
242 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0069  chemotaxis regulator CheZ  35.65 
 
 
242 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3427  chemotaxis regulator CheZ  35.65 
 
 
236 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1691  chemotaxis regulator CheZ  35.65 
 
 
236 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3848  chemotaxis regulator CheZ  35.65 
 
 
236 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3929  chemotaxis regulator CheZ  35.65 
 
 
236 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0936749  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3124  chemotaxis regulator CheZ  35.65 
 
 
236 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.853888  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2619  chemotaxis regulator CheZ  39 
 
 
214 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000452679 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01852  chemotaxis regulator, protein phosphatase for CheY  39.7 
 
 
214 aa  119  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.850509  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1759  chemotaxis phosphatase, CheZ  39.7 
 
 
214 aa  119  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.414683  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01841  hypothetical protein  39.7 
 
 
214 aa  119  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.64287  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0176  chemotaxis regulator CheZ  34.72 
 
 
243 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.72153  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03142  hypothetical protein  36.71 
 
 
246 aa  119  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1977  chemotaxis regulator CheZ  39.7 
 
 
214 aa  119  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2114  chemotaxis regulator CheZ  39.7 
 
 
214 aa  119  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.636511  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1751  chemotaxis regulator CheZ  39.7 
 
 
214 aa  119  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1303  chemotaxis regulator CheZ  39.7 
 
 
214 aa  119  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238575 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1861  chemotaxis regulator CheZ  37.75 
 
 
214 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2605  chemotaxis regulator CheZ  37.75 
 
 
214 aa  118  6e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2075  chemotaxis regulator CheZ  39 
 
 
214 aa  118  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000441375 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2130  chemotaxis regulator CheZ  39 
 
 
214 aa  118  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000301905 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1330  chemotaxis regulator CheZ  39 
 
 
214 aa  118  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000240713 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2070  chemotaxis regulator CheZ  38.5 
 
 
214 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492059 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1207  chemotaxis regulator CheZ  38.5 
 
 
214 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2978  chemotaxis regulator CheZ  38.5 
 
 
214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.943723  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3521  chemotaxis regulator CheZ  38.81 
 
 
214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.328014 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1647  chemotaxis regulator CheZ  38.81 
 
 
214 aa  116  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1759  chemotaxis regulator CheZ  38.81 
 
 
214 aa  116  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1518  chemotaxis regulator CheZ  37.44 
 
 
214 aa  115  6e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4150  chemotaxis phosphatase, CheZ  38.69 
 
 
218 aa  114  6.9999999999999995e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.667805  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02868  chemotaxis protein cheZ  35.61 
 
 
251 aa  111  7.000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0271753  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002834  chemotaxis response - phosphatase CheZ  34.3 
 
 
246 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00740148  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3435  chemotaxis phosphatase, CheZ  34.88 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.244587  normal  0.637664 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1380  chemotaxis phosphatase, CheZ  35.47 
 
 
245 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.659888  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1637  chemotaxis phosphatase, CheZ  34.8 
 
 
245 aa  108  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1652  chemotaxis protein CheZ  33.33 
 
 
239 aa  106  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00206146  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1613  chemotaxis regulator CheZ  40.49 
 
 
230 aa  106  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0936908 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2288  chemotaxis protein CheZ  34.63 
 
 
239 aa  105  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0719  chemotaxis phosphatase, CheZ  36.06 
 
 
248 aa  105  4e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1345  chemotaxis phosphatase, CheZ  35.29 
 
 
245 aa  104  7e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1385  chemotaxis phosphatase, CheZ  36.32 
 
 
245 aa  104  9e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00582364  normal  0.177515 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3047  chemotaxis phosphatase, CheZ  34.5 
 
 
245 aa  104  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0783794 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1981  chemotaxis protein CheZ  33.49 
 
 
228 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.260664  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1301  chemotaxis phosphatase, CheZ  35.64 
 
 
245 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.194293  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1368  chemotaxis phosphatase, CheZ  35.64 
 
 
245 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.724461  normal  0.296544 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1201  chemotaxis phosphatase, CheZ  34.13 
 
 
245 aa  103  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0237799  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1361  chemotaxis phosphatase, CheZ  35.64 
 
 
245 aa  103  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.349045  normal  0.0601628 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3208  chemotaxis protein CheZ  35.15 
 
 
245 aa  102  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2803  chemotaxis phosphatase, CheZ  33.02 
 
 
262 aa  102  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.402968  normal  0.192895 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2174  chemotaxis regulator CheZ  39.2 
 
 
214 aa  102  4e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3028  chemotaxis phosphatase, CheZ  33.66 
 
 
247 aa  101  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1973  chemotaxis phosphatase, CheZ  31.9 
 
 
261 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2557  chemotaxis phosphatase, CheZ  34.83 
 
 
245 aa  100  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.91816  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2917  chemotaxis phosphatase, CheZ  35.32 
 
 
245 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3049  chemotaxis phosphatase, CheZ  34.83 
 
 
245 aa  99.8  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.373943 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1456  chemotaxis phosphatase, CheZ  34.83 
 
 
245 aa  99.4  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.26387  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2907  chemotaxis phosphatase, CheZ  34.83 
 
 
245 aa  98.2  7e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.569265  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3665  chemotaxis phosphatase, CheZ  33.02 
 
 
262 aa  98.2  7e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00761761  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1340  chemotaxis phosphatase, CheZ  33.17 
 
 
258 aa  97.8  9e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0987  chemotaxis phosphatase, CheZ  32.85 
 
 
253 aa  97.8  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.413841 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0475  chemotaxis phosphatase, CheZ  32.71 
 
 
261 aa  96.7  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.51709  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4339  chemotaxis phosphatase, CheZ  32.09 
 
 
262 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.297829  normal  0.458128 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2278  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  33.99 
 
 
245 aa  95.5  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0191817  normal  0.62928 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1528  chemotaxis phosphatase, CheZ  32.09 
 
 
262 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.298774  normal  0.476992 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3908  chemotaxis phosphatase, CheZ  32.56 
 
 
262 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.925973  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45610  chemotaxis protein CheZ  32.42 
 
 
262 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0109918  normal  0.241564 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3426  chemotaxis phosphatase, CheZ  31.31 
 
 
262 aa  94  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.133495  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1565  chemotaxis phosphatase, CheZ  31.63 
 
 
262 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.058559  normal  0.0518536 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2162  chemotaxis protein CheZ  30.56 
 
 
266 aa  93.6  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>