97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2808 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2808  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  100 
 
 		 162 aa  334  2.9999999999999997e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3157  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  100 
 
 		 162 aa  334  2.9999999999999997e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990307 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2911  hypothetical protein  86.42 
 
 		 162 aa  297  4e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5493  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  63.69 
 
 		 157 aa  214  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.317787  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3187  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  61.15 
 
 		 157 aa  206  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5840  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  61.88 
 
 		 161 aa  205  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0018  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated domain-containing protein  60.87 
 
 		 161 aa  202  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.187871  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1535  YbaK  60.87 
 
 		 161 aa  202  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.101769  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1448  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated domain-containing protein  60.87 
 
 		 161 aa  202  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1189  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated domain-containing protein  60.87 
 
 		 161 aa  202  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.31432  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0394  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated domain-containing protein  60.87 
 
 		 161 aa  202  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1037  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated domain-containing protein  60.87 
 
 		 161 aa  202  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.102528  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1541  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  58.64 
 
 		 162 aa  201  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.699288 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0038  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated domain-containing protein  60.87 
 
 		 210 aa  201  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1369  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated domain-containing protein  59.01 
 
 		 161 aa  200  8e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.388098  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5009  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  59.38 
 
 		 161 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.483603  normal  0.195058 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1641  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  58.13 
 
 		 162 aa  197  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0015255  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1640  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  58.13 
 
 		 162 aa  197  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.850648 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1733  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  58.02 
 
 		 162 aa  197  5e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.285708 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1719  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  58.02 
 
 		 162 aa  197  5e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6360  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  58.02 
 
 		 162 aa  197  5e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.444519  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5904  hypothetical protein  56.05 
 
 		 157 aa  184  6e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.515734 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5372  hypothetical protein  52.56 
 
 		 162 aa  166  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000389201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0089  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  43.87 
 
 		 156 aa  137  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4739  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  48.37 
 
 		 159 aa  137  8.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.708243 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4731  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  46.45 
 
 		 167 aa  134  5e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2992  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  42.21 
 
 		 155 aa  132  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3112  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  42.21 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3384  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  41.29 
 
 		 156 aa  127  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195094  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0256  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  42.21 
 
 		 159 aa  127  9.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00658602 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0225  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  44.52 
 
 		 152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1121  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  42.86 
 
 		 156 aa  125  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.305653  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0222  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  43.33 
 
 		 152 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.838167 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0269  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  42.67 
 
 		 152 aa  124  7e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0201  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  43.15 
 
 		 163 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.387657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1354  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  40.91 
 
 		 156 aa  120  7e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.154586  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0168  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  38 
 
 		 153 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3402  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  36.94 
 
 		 159 aa  111  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1260  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  35.03 
 
 		 159 aa  107  5e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160426 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0707  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  36.94 
 
 		 159 aa  107  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1849  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  35.06 
 
 		 173 aa  102  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000316279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0986  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  32.91 
 
 		 159 aa  100  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.015482  normal  0.28852 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0677  YbaK-like protein  34.51 
 
 		 162 aa  99.4  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1215  hypothetical protein  35.71 
 
 		 151 aa  96.3  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1756  hypothetical protein  37.21 
 
 		 152 aa  94  9e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2082  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  39.42 
 
 		 154 aa  93.6  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.184179  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2156  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  36.03 
 
 		 154 aa  93.2  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.284719  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1209  hypothetical protein  35 
 
 		 151 aa  93.2  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1758  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  35.66 
 
 		 154 aa  90.9  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1914  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  34.81 
 
 		 154 aa  90.1  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2486  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  34.81 
 
 		 156 aa  90.1  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1361  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  35.03 
 
 		 159 aa  88.6  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.153741  hitchhiker  0.000577706 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0303  hypothetical protein  36.03 
 
 		 161 aa  88.6  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000014956  unclonable  0.000000628456 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2116  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  34.04 
 
 		 153 aa  87.8  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0022261  decreased coverage  0.00203199 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4653  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain-containing protein  32.26 
 
 		 159 aa  87.8  6e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.321898  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1929  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  34.62 
 
 		 170 aa  85.9  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3621  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  30.77 
 
 		 199 aa  85.5  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000268  hypothetical protein  36.13 
 
 		 159 aa  84.7  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1791  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  30.34 
 
 		 163 aa  82  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3691  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  28.77 
 
 		 173 aa  81.6  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2070  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  31.51 
 
 		 163 aa  81.3  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0237486  normal  0.038928 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2657  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  32.88 
 
 		 169 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.941629  normal  0.15794 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2839  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  30.83 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.604466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0933  hypothetical cytosolic protein  29.58 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3064  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  30.71 
 
 		 244 aa  70.9  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.39899 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1810  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  32.8 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0063966  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1734  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  32.8 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0465271  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2147  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  32 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0310098  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0757  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  28.87 
 
 		 156 aa  67  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.447705  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0795  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  27.14 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.630497  hitchhiker  0.00199357 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2233  putative signal transduction protein  29.56 
 
 		 456 aa  65.5  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0808  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  27.46 
 
 		 156 aa  60.5  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.171786  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0804  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  27.46 
 
 		 156 aa  60.5  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.299415  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1237  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  31.39 
 
 		 160 aa  53.5  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1005  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  32.17 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09630  ybaK/ebsC protein  27.36 
 
 		 161 aa  45.8  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443287  hitchhiker  0.00251062 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5754  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  25.83 
 
 		 163 aa  44.7  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.036925  hitchhiker  0.00000000000572699 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4879  ybaK/ebsC protein  26.02 
 
 		 162 aa  44.3  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.262878  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0850  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  31.58 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0589  prolyl-tRNA synthetase  28.95 
 
 		 574 aa  43.5  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2906  YbaK/EbsC protein  28.57 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0570  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  32.38 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5359  putative signal transduction protein  21.66 
 
 		 467 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42347 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2065  ybaK/ebsC protein  28.07 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5220  putative signal transduction protein  20 
 
 		 467 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  0.743433 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5311  putative signal transduction protein  20 
 
 		 467 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0528676 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0358  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 158 aa  42  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1441  ybaK/ebsC protein  33.01 
 
 		 162 aa  42  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.63405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3880  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  27.14 
 
 		 176 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.745877  normal  0.0848334 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4341  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  27.59 
 
 		 173 aa  42  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0170  ybaK/ebsC protein  28.43 
 
 		 161 aa  41.6  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6123  hypothetical protein  24.64 
 
 		 469 aa  41.6  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3720  putative signal transduction protein  20.87 
 
 		 464 aa  40.8  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1461  ybaK/ebsC protein  29.7 
 
 		 155 aa  40.8  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3090  ybaK/ebsC protein  28.71 
 
 		 155 aa  40.8  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00342065  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0162  putative signal transduction protein  21.14 
 
 		 467 aa  40.8  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.102172  normal  0.229614 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4795  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  25.64 
 
 		 159 aa  40.4  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.075177  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>