33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2277 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2277  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  531  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110769  hitchhiker  0.0000150727 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01962  hypothetical protein  47 
 
 		 103 aa  107  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0567  hypothetical protein  39.87 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.903603  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2275  putative bacteriophage-related protein  40.88 
 
 		 149 aa  92  7e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.480851  hitchhiker  0.000050129 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3232  putative bacteriophage-related protein  37.5 
 
 		 182 aa  85.9  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550197 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1171  hypothetical protein  38.17 
 
 		 162 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.563844  normal  0.518336 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1919  hypothetical protein  36.29 
 
 		 169 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252586  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3236  putative bacteriophage-related protein  38.41 
 
 		 183 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.012478 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3848  hypothetical protein  46.38 
 
 		 143 aa  73.6  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0110186  normal  0.347936 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1141  hypothetical protein  34.62 
 
 		 163 aa  73.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5240  hypothetical protein  37.1 
 
 		 180 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3193  bacteriophage T7-like gene protein  34.09 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0775029 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1317  hypothetical protein  34.09 
 
 		 201 aa  71.2  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.535734  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3303  hypothetical protein  28.65 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1136  hypothetical protein  28.47 
 
 		 178 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0310842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2915  HNH endonuclease  41.03 
 
 		 124 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2959  HNH endonuclease  41.03 
 
 		 124 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.988934 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5265  hypothetical protein  25.13 
 
 		 286 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.550058 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1679  hypothetical protein  37.5 
 
 		 121 aa  53.5  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0829221  normal  0.187095 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0232  hypothetical protein  34.09 
 
 		 194 aa  53.1  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5764  hypothetical protein  34.94 
 
 		 285 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5388  hypothetical protein  34.94 
 
 		 242 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0262  hypothetical protein  31.3 
 
 		 193 aa  51.6  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.580956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5477  hypothetical protein  34.94 
 
 		 285 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0193619  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2857  HNH endonuclease  32.43 
 
 		 175 aa  50.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000321269  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0235  hypothetical protein  33.67 
 
 		 235 aa  49.7  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6150  bacteriophage protein  34.09 
 
 		 115 aa  49.7  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.801978  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4702  hypothetical protein  33.54 
 
 		 164 aa  48.5  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.121096  normal  0.331234 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1233  hypothetical protein  26.77 
 
 		 151 aa  47.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0114459  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3899  hypothetical protein  32.14 
 
 		 289 aa  43.9  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3732  hypothetical protein  31.4 
 
 		 167 aa  43.1  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3045  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  42.7  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000840458  normal  0.254242 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0342  hypothetical protein  27.64 
 
 		 289 aa  42  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.844394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>