13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0235 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0235  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  486  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0232  hypothetical protein  44.21 
 
 		 194 aa  171  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1317  hypothetical protein  43.75 
 
 		 201 aa  156  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.535734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0262  hypothetical protein  43.92 
 
 		 193 aa  155  4e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.580956  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3232  putative bacteriophage-related protein  33.33 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550197 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0557  response regulator receiver protein  37.33 
 
 		 238 aa  58.5  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2275  putative bacteriophage-related protein  29.93 
 
 		 149 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.480851  hitchhiker  0.000050129 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0567  hypothetical protein  30.53 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.903603  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2277  hypothetical protein  30.08 
 
 		 257 aa  52  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110769  hitchhiker  0.0000150727 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3193  bacteriophage T7-like gene protein  31.88 
 
 		 160 aa  50.8  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0775029 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3236  putative bacteriophage-related protein  30.22 
 
 		 183 aa  49.3  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.012478 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3568  HNH endonuclease  35.19 
 
 		 214 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1153  hypothetical protein  30.77 
 
 		 96 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.36149 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>