22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3193 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3193  bacteriophage T7-like gene protein  100 
 
 		 160 aa  329  8e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0775029 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3232  putative bacteriophage-related protein  36.65 
 
 		 182 aa  103  9e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550197 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0567  hypothetical protein  38.82 
 
 		 210 aa  100  7e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.903603  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3236  putative bacteriophage-related protein  39.26 
 
 		 183 aa  99.8  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.012478 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1919  hypothetical protein  37.86 
 
 		 169 aa  87.4  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252586  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5240  hypothetical protein  37.69 
 
 		 180 aa  86.3  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1171  hypothetical protein  36.89 
 
 		 162 aa  84.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.563844  normal  0.518336 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1141  hypothetical protein  32.9 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2277  hypothetical protein  34.09 
 
 		 257 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110769  hitchhiker  0.0000150727 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1317  hypothetical protein  33.74 
 
 		 201 aa  62  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.535734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1136  hypothetical protein  36.67 
 
 		 178 aa  60.8  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0310842  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2275  putative bacteriophage-related protein  35.85 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.480851  hitchhiker  0.000050129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2915  HNH endonuclease  40.45 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2959  HNH endonuclease  40.45 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.988934 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3045  hypothetical protein  43.48 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000840458  normal  0.254242 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0232  hypothetical protein  32.12 
 
 		 194 aa  53.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1759  hypothetical protein  36.47 
 
 		 140 aa  47.8  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0262  hypothetical protein  33.57 
 
 		 193 aa  46.2  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.580956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3732  hypothetical protein  30.23 
 
 		 167 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4929  hypothetical protein  33.02 
 
 		 198 aa  45.1  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4702  hypothetical protein  33.93 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.121096  normal  0.331234 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0235  hypothetical protein  34 
 
 		 235 aa  40.8  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>