18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1171 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1171  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  346  8e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.563844  normal  0.518336 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3236  putative bacteriophage-related protein  35.71 
 
 		 183 aa  85.9  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.012478 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3193  bacteriophage T7-like gene protein  36.89 
 
 		 160 aa  84.7  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0775029 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2277  hypothetical protein  38.17 
 
 		 257 aa  85.1  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110769  hitchhiker  0.0000150727 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3232  putative bacteriophage-related protein  35.11 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550197 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1919  hypothetical protein  36.92 
 
 		 169 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252586  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5240  hypothetical protein  46.91 
 
 		 180 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2275  putative bacteriophage-related protein  46 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.480851  hitchhiker  0.000050129 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1141  hypothetical protein  33.99 
 
 		 163 aa  73.9  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0567  hypothetical protein  34.45 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.903603  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2959  HNH endonuclease  39.13 
 
 		 124 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.988934 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2915  HNH endonuclease  39.13 
 
 		 124 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1679  hypothetical protein  35.48 
 
 		 121 aa  50.8  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0829221  normal  0.187095 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3045  hypothetical protein  40.91 
 
 		 131 aa  48.5  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000840458  normal  0.254242 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1317  hypothetical protein  33.65 
 
 		 201 aa  47.8  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.535734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0232  hypothetical protein  29.84 
 
 		 194 aa  44.7  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1136  hypothetical protein  31.08 
 
 		 178 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0310842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6150  bacteriophage protein  35.53 
 
 		 115 aa  42.4  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.801978  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>