25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3236 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3236  putative bacteriophage-related protein  100 
 
 		 183 aa  382  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.012478 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3232  putative bacteriophage-related protein  41.67 
 
 		 182 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550197 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3193  bacteriophage T7-like gene protein  39.26 
 
 		 160 aa  99.8  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0775029 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1919  hypothetical protein  38.89 
 
 		 169 aa  94  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252586  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2275  putative bacteriophage-related protein  36.49 
 
 		 149 aa  89.4  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.480851  hitchhiker  0.000050129 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0567  hypothetical protein  41.1 
 
 		 210 aa  88.6  5e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.903603  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1171  hypothetical protein  35.71 
 
 		 162 aa  85.9  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.563844  normal  0.518336 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5240  hypothetical protein  38.41 
 
 		 180 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2277  hypothetical protein  38.41 
 
 		 257 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110769  hitchhiker  0.0000150727 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3568  HNH endonuclease  36.13 
 
 		 214 aa  62  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1141  hypothetical protein  32 
 
 		 163 aa  62  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0232  hypothetical protein  30.54 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1136  hypothetical protein  32.63 
 
 		 178 aa  52  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0310842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3732  hypothetical protein  36.73 
 
 		 167 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1317  hypothetical protein  28.21 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.535734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0262  hypothetical protein  32.37 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.580956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1693  hypothetical protein  30.61 
 
 		 236 aa  47  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0614123 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1432  hypothetical protein  34.69 
 
 		 193 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1450  hypothetical protein  34.69 
 
 		 193 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4702  hypothetical protein  34.91 
 
 		 164 aa  47  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.121096  normal  0.331234 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2915  HNH endonuclease  35.44 
 
 		 124 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2959  HNH endonuclease  35.44 
 
 		 124 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.988934 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4929  hypothetical protein  33.01 
 
 		 198 aa  45.1  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1759  hypothetical protein  38.36 
 
 		 140 aa  42  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0884  Resolvase domain protein  36.67 
 
 		 187 aa  41.2  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000364698  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>