16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3568 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3568  HNH endonuclease  100 
 
 		 214 aa  436  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3236  putative bacteriophage-related protein  36.13 
 
 		 183 aa  62  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.012478 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1876  prophage LambdaSa2, HNH endonuclease family protein  29.86 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00409455  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4240  NUMOD4 domain protein  32.56 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3019  hypothetical protein  30.34 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0262  hypothetical protein  31.97 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.580956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1962  HNH endonuclease  30.57 
 
 		 190 aa  53.1  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0232  hypothetical protein  31.78 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3832  NUMOD4 domain-containing protein  31.03 
 
 		 179 aa  51.6  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000542576 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5063  NUMOD4 domain-containing protein  26.55 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.996691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0235  hypothetical protein  35.19 
 
 		 235 aa  49.3  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3232  putative bacteriophage-related protein  28.48 
 
 		 182 aa  46.6  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550197 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1317  hypothetical protein  25.19 
 
 		 201 aa  45.4  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.535734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2857  HNH endonuclease  27.18 
 
 		 175 aa  45.1  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000321269  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0567  hypothetical protein  31.25 
 
 		 210 aa  42.4  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.903603  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6984  putative bacteriophage-related protein  83.33 
 
 		 174 aa  42  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>