15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1317 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1317  hypothetical protein  100 
 
 		 201 aa  424  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.535734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0232  hypothetical protein  40.72 
 
 		 194 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0235  hypothetical protein  43.75 
 
 		 235 aa  144  7.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0262  hypothetical protein  40.21 
 
 		 193 aa  137  8.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.580956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0567  hypothetical protein  29.74 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.903603  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2277  hypothetical protein  34.09 
 
 		 257 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110769  hitchhiker  0.0000150727 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3193  bacteriophage T7-like gene protein  33.74 
 
 		 160 aa  62  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0775029 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1141  hypothetical protein  33.33 
 
 		 163 aa  58.2  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1919  hypothetical protein  28.95 
 
 		 169 aa  52.4  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252586  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3236  putative bacteriophage-related protein  28.21 
 
 		 183 aa  50.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.012478 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2275  putative bacteriophage-related protein  34.83 
 
 		 149 aa  48.9  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.480851  hitchhiker  0.000050129 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3232  putative bacteriophage-related protein  29.45 
 
 		 182 aa  48.1  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550197 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1171  hypothetical protein  33.65 
 
 		 162 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.563844  normal  0.518336 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1136  hypothetical protein  27.03 
 
 		 178 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0310842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3568  HNH endonuclease  25.19 
 
 		 214 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>