15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0262 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0262  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  396  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.580956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0232  hypothetical protein  46.35 
 
 		 194 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0235  hypothetical protein  43.92 
 
 		 235 aa  148  6e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1317  hypothetical protein  40.21 
 
 		 201 aa  137  7.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.535734  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3232  putative bacteriophage-related protein  37.76 
 
 		 182 aa  72.4  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550197 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0567  hypothetical protein  32.52 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.903603  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2275  putative bacteriophage-related protein  31.43 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.480851  hitchhiker  0.000050129 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3568  HNH endonuclease  31.97 
 
 		 214 aa  54.7  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2277  hypothetical protein  31.3 
 
 		 257 aa  51.6  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110769  hitchhiker  0.0000150727 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3236  putative bacteriophage-related protein  32.37 
 
 		 183 aa  50.1  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.012478 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2915  HNH endonuclease  30.89 
 
 		 124 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2959  HNH endonuclease  30.89 
 
 		 124 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.988934 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3193  bacteriophage T7-like gene protein  33.57 
 
 		 160 aa  46.2  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0775029 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1141  hypothetical protein  29.93 
 
 		 163 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5240  hypothetical protein  29.17 
 
 		 180 aa  41.2  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>