20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2959 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2915  HNH endonuclease  100 
 
 
124 aa  258  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2959  HNH endonuclease  100 
 
 
124 aa  258  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.988934 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3045  hypothetical protein  48.05 
 
 
131 aa  65.5  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000840458  normal  0.254242 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2277  hypothetical protein  41.03 
 
 
257 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110769  hitchhiker  0.0000150727 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3193  bacteriophage T7-like gene protein  40.45 
 
 
160 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0775029 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3232  putative bacteriophage-related protein  38.82 
 
 
182 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00550197 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1919  hypothetical protein  44.29 
 
 
169 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252586  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0567  hypothetical protein  33.09 
 
 
210 aa  57.8  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.903603  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6150  bacteriophage protein  37.36 
 
 
115 aa  55.1  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.801978  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1171  hypothetical protein  39.13 
 
 
162 aa  50.8  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.563844  normal  0.518336 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1759  hypothetical protein  40.26 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2275  putative bacteriophage-related protein  37.35 
 
 
149 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.480851  hitchhiker  0.000050129 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1679  hypothetical protein  35.96 
 
 
121 aa  47  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0829221  normal  0.187095 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0262  hypothetical protein  30.89 
 
 
193 aa  47  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.580956  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3236  putative bacteriophage-related protein  35.44 
 
 
183 aa  46.2  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.012478 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5240  hypothetical protein  36.25 
 
 
180 aa  45.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0232  hypothetical protein  31.71 
 
 
194 aa  43.9  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1317  hypothetical protein  30.15 
 
 
201 aa  40.8  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.535734  normal 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4251  hypothetical protein  33.33 
 
 
210 aa  40.8  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.139204  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0251  hypothetical protein  29.89 
 
 
190 aa  40  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>