18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A5240 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5240  hypothetical protein  100 
 
 
180 aa  376  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3232  putative bacteriophage-related protein  43.44 
 
 
182 aa  94.4  9e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00550197 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1919  hypothetical protein  40.91 
 
 
169 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252586  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3193  bacteriophage T7-like gene protein  37.69 
 
 
160 aa  86.3  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0775029 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3236  putative bacteriophage-related protein  38.41 
 
 
183 aa  82  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.012478 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1171  hypothetical protein  46.91 
 
 
162 aa  81.3  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.563844  normal  0.518336 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2277  hypothetical protein  37.1 
 
 
257 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110769  hitchhiker  0.0000150727 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0567  hypothetical protein  35.9 
 
 
210 aa  63.9  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.903603  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1136  hypothetical protein  30.83 
 
 
178 aa  62.4  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0310842  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0232  hypothetical protein  34.21 
 
 
194 aa  57.4  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1759  hypothetical protein  40.23 
 
 
140 aa  57.4  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2275  putative bacteriophage-related protein  33.94 
 
 
149 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.480851  hitchhiker  0.000050129 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3045  hypothetical protein  37.35 
 
 
131 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000840458  normal  0.254242 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1141  hypothetical protein  32.09 
 
 
163 aa  48.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2915  HNH endonuclease  36.25 
 
 
124 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2959  HNH endonuclease  36.25 
 
 
124 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.988934 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4929  hypothetical protein  28.32 
 
 
198 aa  42.7  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0262  hypothetical protein  29.17 
 
 
193 aa  41.2  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.580956  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>