19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1141 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1141  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  341  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0567  hypothetical protein  39.24 
 
 
210 aa  88.2  5e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.903603  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3232  putative bacteriophage-related protein  34.78 
 
 
182 aa  80.9  0.000000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00550197 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1919  hypothetical protein  36.15 
 
 
169 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252586  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1171  hypothetical protein  33.99 
 
 
162 aa  73.9  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.563844  normal  0.518336 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2277  hypothetical protein  34.62 
 
 
257 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110769  hitchhiker  0.0000150727 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3193  bacteriophage T7-like gene protein  32.9 
 
 
160 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0775029 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3236  putative bacteriophage-related protein  32 
 
 
183 aa  62  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.012478 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2275  putative bacteriophage-related protein  34.11 
 
 
149 aa  60.8  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.480851  hitchhiker  0.000050129 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1136  hypothetical protein  29.01 
 
 
178 aa  60.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0310842  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1317  hypothetical protein  33.33 
 
 
201 aa  58.2  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.535734  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1693  hypothetical protein  33.71 
 
 
236 aa  48.1  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0614123 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5240  hypothetical protein  32.09 
 
 
180 aa  48.1  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0695  hypothetical protein  31.43 
 
 
175 aa  44.7  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0000412678  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0262  hypothetical protein  29.93 
 
 
193 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.580956  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0232  hypothetical protein  28.15 
 
 
194 aa  43.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1462  hypothetical protein  28.39 
 
 
175 aa  42  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.463782  normal  0.0284757 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5063  NUMOD4 domain-containing protein  34.62 
 
 
190 aa  41.6  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.996691  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0235  hypothetical protein  28.87 
 
 
235 aa  40.8  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>