25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1919 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1919  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  357  5e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252586  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3236  putative bacteriophage-related protein  38.89 
 
 		 183 aa  94  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.012478 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5240  hypothetical protein  40.91 
 
 		 180 aa  90.1  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3232  putative bacteriophage-related protein  33.77 
 
 		 182 aa  88.2  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550197 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3193  bacteriophage T7-like gene protein  37.86 
 
 		 160 aa  87.4  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0775029 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1171  hypothetical protein  36.92 
 
 		 162 aa  82.4  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.563844  normal  0.518336 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2275  putative bacteriophage-related protein  35.62 
 
 		 149 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.480851  hitchhiker  0.000050129 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2277  hypothetical protein  36.29 
 
 		 257 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110769  hitchhiker  0.0000150727 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1141  hypothetical protein  36.15 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0567  hypothetical protein  30.43 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.903603  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2915  HNH endonuclease  44.29 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2959  HNH endonuclease  44.29 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.988934 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1317  hypothetical protein  28.95 
 
 		 201 aa  52.4  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.535734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1136  hypothetical protein  26.76 
 
 		 178 aa  52.4  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0310842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3045  hypothetical protein  38.24 
 
 		 131 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000840458  normal  0.254242 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0232  hypothetical protein  30.08 
 
 		 194 aa  46.2  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1759  hypothetical protein  36.11 
 
 		 140 aa  45.4  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0695  hypothetical protein  30.77 
 
 		 175 aa  45.4  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0000412678  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0251  hypothetical protein  30 
 
 		 190 aa  44.7  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  52.63 
 
 		 186 aa  43.9  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1693  hypothetical protein  29.07 
 
 		 236 aa  42  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0614123 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4929  hypothetical protein  31.91 
 
 		 198 aa  41.2  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1679  hypothetical protein  29.09 
 
 		 121 aa  40.8  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0829221  normal  0.187095 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0262  hypothetical protein  28.68 
 
 		 193 aa  40.8  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.580956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3732  hypothetical protein  27 
 
 		 167 aa  40.8  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>