19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0232 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0232  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  401  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0262  hypothetical protein  46.35 
 
 		 193 aa  179  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.580956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0235  hypothetical protein  44.21 
 
 		 235 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1317  hypothetical protein  40.72 
 
 		 201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.535734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0567  hypothetical protein  29.53 
 
 		 210 aa  64.7  0.0000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.903603  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3232  putative bacteriophage-related protein  28.76 
 
 		 182 aa  62  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550197 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3236  putative bacteriophage-related protein  30.54 
 
 		 183 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.012478 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2275  putative bacteriophage-related protein  32.35 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.480851  hitchhiker  0.000050129 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5240  hypothetical protein  34.21 
 
 		 180 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2277  hypothetical protein  34.09 
 
 		 257 aa  53.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110769  hitchhiker  0.0000150727 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3193  bacteriophage T7-like gene protein  32.12 
 
 		 160 aa  53.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0775029 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3568  HNH endonuclease  31.78 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0557  response regulator receiver protein  51.16 
 
 		 238 aa  48.1  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1919  hypothetical protein  30.08 
 
 		 169 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252586  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1171  hypothetical protein  29.84 
 
 		 162 aa  44.7  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.563844  normal  0.518336 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2915  HNH endonuclease  31.71 
 
 		 124 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2959  HNH endonuclease  31.71 
 
 		 124 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.988934 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1759  hypothetical protein  34.57 
 
 		 140 aa  43.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1141  hypothetical protein  28.15 
 
 		 163 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>