24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3232 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3232  putative bacteriophage-related protein  100 
 
 		 182 aa  373  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550197 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3236  putative bacteriophage-related protein  41.67 
 
 		 183 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.012478 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3193  bacteriophage T7-like gene protein  36.65 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0775029 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0567  hypothetical protein  42.04 
 
 		 210 aa  97.1  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.903603  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5240  hypothetical protein  43.44 
 
 		 180 aa  94.4  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2275  putative bacteriophage-related protein  35.53 
 
 		 149 aa  88.6  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.480851  hitchhiker  0.000050129 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1919  hypothetical protein  33.77 
 
 		 169 aa  88.2  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252586  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2277  hypothetical protein  37.5 
 
 		 257 aa  85.9  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110769  hitchhiker  0.0000150727 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1171  hypothetical protein  35.11 
 
 		 162 aa  82.8  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.563844  normal  0.518336 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1141  hypothetical protein  34.78 
 
 		 163 aa  80.9  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0262  hypothetical protein  37.76 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.580956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0232  hypothetical protein  28.76 
 
 		 194 aa  62  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2959  HNH endonuclease  38.82 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.988934 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2915  HNH endonuclease  38.82 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1136  hypothetical protein  29.93 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0310842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3045  hypothetical protein  33.98 
 
 		 131 aa  57  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000840458  normal  0.254242 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3732  hypothetical protein  29.75 
 
 		 167 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0235  hypothetical protein  33.02 
 
 		 235 aa  50.4  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1317  hypothetical protein  29.45 
 
 		 201 aa  48.1  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.535734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3568  HNH endonuclease  28.48 
 
 		 214 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1450  hypothetical protein  28.69 
 
 		 193 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1432  hypothetical protein  28.69 
 
 		 193 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4702  hypothetical protein  32.31 
 
 		 164 aa  45.4  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.121096  normal  0.331234 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0251  hypothetical protein  31.4 
 
 		 190 aa  43.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>