23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0567 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0567  hypothetical protein  100 
 
 
210 aa  431  1e-120  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.903603  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2277  hypothetical protein  39.87 
 
 
257 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110769  hitchhiker  0.0000150727 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3193  bacteriophage T7-like gene protein  38.82 
 
 
160 aa  100  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0775029 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3232  putative bacteriophage-related protein  42.04 
 
 
182 aa  97.1  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00550197 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3236  putative bacteriophage-related protein  41.1 
 
 
183 aa  88.6  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.012478 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1141  hypothetical protein  39.24 
 
 
163 aa  88.2  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2275  putative bacteriophage-related protein  35.66 
 
 
149 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.480851  hitchhiker  0.000050129 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1317  hypothetical protein  29.74 
 
 
201 aa  75.1  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.535734  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1171  hypothetical protein  34.45 
 
 
162 aa  69.7  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.563844  normal  0.518336 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0232  hypothetical protein  29.53 
 
 
194 aa  64.7  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5240  hypothetical protein  35.9 
 
 
180 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0262  hypothetical protein  32.52 
 
 
193 aa  62.8  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.580956  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1919  hypothetical protein  30.43 
 
 
169 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252586  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1136  hypothetical protein  30 
 
 
178 aa  58.5  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0310842  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2915  HNH endonuclease  33.09 
 
 
124 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2959  HNH endonuclease  33.09 
 
 
124 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.988934 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4702  hypothetical protein  34.72 
 
 
164 aa  47  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.121096  normal  0.331234 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3428  GIY-YIG catalytic domain-containing protein  36.36 
 
 
246 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2656  resolvase domain-containing protein  63.89 
 
 
200 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.14772 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3568  HNH endonuclease  31.25 
 
 
214 aa  42.4  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0235  hypothetical protein  29.32 
 
 
235 aa  42.4  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1759  hypothetical protein  37.5 
 
 
140 aa  42.4  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3732  hypothetical protein  33.33 
 
 
167 aa  41.6  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>