18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2275 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2275  putative bacteriophage-related protein  100 
 
 		 149 aa  313  6e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.480851  hitchhiker  0.000050129 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2277  hypothetical protein  40.88 
 
 		 257 aa  92  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110769  hitchhiker  0.0000150727 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3232  putative bacteriophage-related protein  35.53 
 
 		 182 aa  88.6  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550197 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3236  putative bacteriophage-related protein  36.49 
 
 		 183 aa  89.4  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.012478 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0567  hypothetical protein  35.66 
 
 		 210 aa  80.9  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.903603  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1919  hypothetical protein  35.62 
 
 		 169 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252586  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1171  hypothetical protein  46 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.563844  normal  0.518336 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0262  hypothetical protein  31.43 
 
 		 193 aa  61.2  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.580956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1141  hypothetical protein  34.11 
 
 		 163 aa  60.8  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3193  bacteriophage T7-like gene protein  35.85 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0775029 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0232  hypothetical protein  32.35 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5240  hypothetical protein  33.94 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1136  hypothetical protein  32 
 
 		 178 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0310842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1317  hypothetical protein  34.83 
 
 		 201 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.535734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2959  HNH endonuclease  37.35 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.988934 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2915  HNH endonuclease  37.35 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0235  hypothetical protein  31.46 
 
 		 235 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4929  hypothetical protein  28.57 
 
 		 198 aa  40.8  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>