16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1962 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1962  HNH endonuclease  100 
 
 		 190 aa  396  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1876  prophage LambdaSa2, HNH endonuclease family protein  34.46 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00409455  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1450  HNH endonuclease  36.54 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2857  HNH endonuclease  30.86 
 
 		 175 aa  61.2  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000321269  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0660  hypothetical protein  29.67 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.22037 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4965  prophage LambdaBa03, HNH endonuclease family protein  34.12 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00488309  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5344  prophage LambdaBa03, HNH endonuclease family protein  34.12 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000857562  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3568  HNH endonuclease  30.57 
 
 		 214 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0604  homing nuclease  37.61 
 
 		 243 aa  52.4  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000399673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0666  homing nuclease  37.61 
 
 		 243 aa  52.4  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000787061  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1512  HNH endonuclease family protein  35.65 
 
 		 274 aa  52  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0327042  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0880  HNH endonuclease  34.94 
 
 		 178 aa  49.7  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3019  hypothetical protein  26.2 
 
 		 197 aa  48.5  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3832  NUMOD4 domain-containing protein  28.24 
 
 		 179 aa  44.7  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000542576 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4224  hypothetical protein  31.13 
 
 		 250 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000588859  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2283  HNH endonuclease  31.33 
 
 		 159 aa  41.2  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0121568  normal  0.082249 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>