17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0666 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0604  homing nuclease  100 
 
 		 243 aa  501  1e-141  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000399673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0666  homing nuclease  100 
 
 		 243 aa  501  1e-141  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000787061  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1876  prophage LambdaSa2, HNH endonuclease family protein  38.51 
 
 		 176 aa  109  4.0000000000000004e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00409455  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2857  HNH endonuclease  36.13 
 
 		 175 aa  65.9  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000321269  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2283  HNH endonuclease  42.39 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0121568  normal  0.082249 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3832  NUMOD4 domain-containing protein  32.74 
 
 		 179 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000542576 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4965  prophage LambdaBa03, HNH endonuclease family protein  41.35 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00488309  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5344  prophage LambdaBa03, HNH endonuclease family protein  41.35 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000857562  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1450  HNH endonuclease  40.82 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1512  HNH endonuclease family protein  33.85 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0327042  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4240  NUMOD4 domain protein  34.41 
 
 		 223 aa  52.4  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1962  HNH endonuclease  37.61 
 
 		 190 aa  52.4  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0660  hypothetical protein  33.66 
 
 		 189 aa  50.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.22037 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0647  hypothetical protein  24.39 
 
 		 239 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4675  NUMOD4 domain-containing protein  35.58 
 
 		 194 aa  45.8  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3073  NUMOD4 domain protein  28.74 
 
 		 177 aa  45.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2374  Nuclease-associated modular DNA-binding 1  30.34 
 
 		 255 aa  43.1  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.100378 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>