15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0880 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0880  HNH endonuclease  100 
 
 		 178 aa  368  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3200  pathogenesis-related transcriptional factor and ERF protein  37.6 
 
 		 174 aa  73.9  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.206067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6243  putative endonuclease  47.95 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.0000281378  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0299  HNH endonuclease  51.72 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.538938  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2362  hypothetical protein  41.76 
 
 		 175 aa  65.1  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00840097  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_3001  endonuclease  33.9 
 
 		 168 aa  57.4  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0412005  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0208  HNH endonuclease  31.34 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.174536  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1778  hypothetical protein  39.08 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.448139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1962  HNH endonuclease  34.94 
 
 		 190 aa  49.7  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3383  hypothetical protein  30.88 
 
 		 203 aa  49.7  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4702  hypothetical protein  41.07 
 
 		 279 aa  45.8  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.427469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3201  pathogenesis-related transcriptional factor and ERF protein  26.28 
 
 		 166 aa  44.7  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.295618  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3682  hypothetical protein  31.34 
 
 		 282 aa  44.3  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4092  pathogenesis-related transcriptional factor and ERF protein  35.06 
 
 		 181 aa  42.4  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127569 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4224  hypothetical protein  36.07 
 
 		 250 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000588859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>