80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3899 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3899  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  579  1e-164  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5477  hypothetical protein  39.64 
 
 		 285 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0193619  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5764  hypothetical protein  38.93 
 
 		 285 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5265  hypothetical protein  39.16 
 
 		 286 aa  160  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.550058 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5388  hypothetical protein  40.16 
 
 		 242 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3303  hypothetical protein  33.92 
 
 		 279 aa  132  9e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5155  protein of unknown function DUF559  33.45 
 
 		 311 aa  105  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1506  hypothetical protein  33.67 
 
 		 306 aa  89.4  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1560  hypothetical protein  29.93 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.426763  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2561  hypothetical protein  28.87 
 
 		 285 aa  80.9  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.465825  normal  0.0508989 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1942  hypothetical protein  27.33 
 
 		 357 aa  80.1  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.116952 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0631  hypothetical protein  28.32 
 
 		 284 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0729308 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0651  hypothetical protein  28.32 
 
 		 284 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.617524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0638  hypothetical protein  28.32 
 
 		 284 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0621  hypothetical protein  29.37 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.568124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0608  hypothetical protein  29.37 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.876444  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0599  hypothetical protein  29.37 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1053  protein of unknown function DUF559  32.59 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100575  normal  0.261729 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4768  protein of unknown function DUF559  28.93 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.146214  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1355  hypothetical protein  26.67 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0634709  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1723  hypothetical protein  29.17 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0541732 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3817  hypothetical protein  29.47 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.590665  normal  0.529394 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0096  hypothetical protein  24.83 
 
 		 286 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13588  hypothetical protein  27.01 
 
 		 289 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0436638 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0086  hypothetical protein  26.97 
 
 		 278 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0105  hypothetical protein  24.83 
 
 		 286 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2158  hypothetical protein  28.99 
 
 		 321 aa  54.3  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2878  hypothetical protein  36.9 
 
 		 302 aa  53.1  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4824  hypothetical protein  27.5 
 
 		 295 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1580  protein of unknown function DUF559  29.77 
 
 		 305 aa  52.4  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3520  hypothetical protein  26.67 
 
 		 314 aa  50.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.051391  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1165  hypothetical protein  27.62 
 
 		 302 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000066316 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20280  hypothetical protein  26.42 
 
 		 330 aa  49.7  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0804  hypothetical protein  27.99 
 
 		 318 aa  49.7  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4629  hypothetical protein  25.68 
 
 		 277 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5044  hypothetical protein  25.09 
 
 		 291 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4717  hypothetical protein  25.68 
 
 		 277 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247054  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0561  hypothetical protein  32.97 
 
 		 320 aa  48.9  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.273722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0597  hypothetical protein  23.28 
 
 		 320 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4159  hypothetical protein  26.06 
 
 		 276 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00219007  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0726  hypothetical protein  27.98 
 
 		 310 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2535  hypothetical protein  25.09 
 
 		 321 aa  47.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2841  protein of unknown function DUF559  35.85 
 
 		 148 aa  47  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00016732  normal  0.493476 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5011  hypothetical protein  25.17 
 
 		 277 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.938275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3039  hypothetical protein  27.7 
 
 		 289 aa  47.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000250216  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2812  hypothetical protein  31.52 
 
 		 261 aa  46.6  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.437661  normal  0.0518068 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1233  hypothetical protein  32.89 
 
 		 151 aa  46.6  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0114459  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2364  hypothetical protein  30.9 
 
 		 299 aa  46.6  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12277  hypothetical protein  26.06 
 
 		 295 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000026926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1335  hypothetical protein  26.32 
 
 		 293 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.402305 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0989  hypothetical protein  25.17 
 
 		 320 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0711273  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0999  hypothetical protein  25.17 
 
 		 320 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0971  hypothetical protein  25.17 
 
 		 320 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3354  hypothetical protein  27.01 
 
 		 374 aa  45.8  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0068  hypothetical protein  29.52 
 
 		 276 aa  45.1  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1692  hypothetical protein  25.86 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.360943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17370  hypothetical protein  28.43 
 
 		 351 aa  45.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00299301 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18420  hypothetical protein  29.66 
 
 		 306 aa  45.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.056172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3715  hypothetical protein  30.94 
 
 		 272 aa  45.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0742  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.2 
 
 		 1861 aa  45.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2824  protein of unknown function DUF559  27.46 
 
 		 283 aa  44.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0136609 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0898  hypothetical protein  30.87 
 
 		 290 aa  44.3  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0019  hypothetical protein  26.96 
 
 		 317 aa  44.3  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0256854  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11511  hypothetical protein  25.53 
 
 		 280 aa  44.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.494625 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5526  hypothetical protein  24.24 
 
 		 298 aa  44.3  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0955  hypothetical protein  27.76 
 
 		 307 aa  44.3  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2277  hypothetical protein  32.14 
 
 		 257 aa  43.9  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110769  hitchhiker  0.0000150727 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1533  hypothetical protein  26.96 
 
 		 302 aa  44.3  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.837222  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2516  hypothetical protein  27.54 
 
 		 316 aa  43.5  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0713675  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0914  hypothetical protein  31.25 
 
 		 316 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.462598 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4443  hypothetical protein  25 
 
 		 291 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.353827  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4530  hypothetical protein  25 
 
 		 291 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.724398  normal  0.679375 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4812  hypothetical protein  29.37 
 
 		 307 aa  43.1  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00673201 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5457  hypothetical protein  26.62 
 
 		 301 aa  43.5  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597295 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1181  hypothetical protein  24.7 
 
 		 267 aa  42.7  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.59676 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1970  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  31.17 
 
 		 1853 aa  42.7  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.525095 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1289  hypothetical protein  24.54 
 
 		 294 aa  42.7  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.17962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16880  hypothetical protein  30.07 
 
 		 327 aa  42.4  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.38822  normal  0.977824 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0966  hypothetical protein  26.1 
 
 		 275 aa  42.7  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22240  hypothetical protein  37.14 
 
 		 375 aa  42.4  0.01  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.527189  normal  0.11385 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>