135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2158 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2158  hypothetical protein  100 
 
 
321 aa  626  1e-178  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1339  hypothetical protein  46.64 
 
 
262 aa  201  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334499  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0726  hypothetical protein  34.59 
 
 
310 aa  154  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0740  hypothetical protein  36.66 
 
 
337 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0597  hypothetical protein  31.72 
 
 
320 aa  133  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3354  hypothetical protein  34.56 
 
 
374 aa  134  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1897  hypothetical protein  37.7 
 
 
317 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.221334  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2364  hypothetical protein  36.7 
 
 
299 aa  125  7e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0955  hypothetical protein  35.1 
 
 
307 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31410  hypothetical protein  38.86 
 
 
310 aa  108  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.372839  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1976  hypothetical protein  35.49 
 
 
336 aa  100  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000667209 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2531  hypothetical protein  34.57 
 
 
306 aa  100  4e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3520  hypothetical protein  30.23 
 
 
314 aa  99  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.051391  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1355  hypothetical protein  33.44 
 
 
335 aa  97.8  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0634709  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1181  hypothetical protein  36.41 
 
 
267 aa  96.7  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.59676 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5457  hypothetical protein  31.05 
 
 
301 aa  94  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.597295 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4654  hypothetical protein  32.84 
 
 
289 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.397587  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1723  hypothetical protein  37.08 
 
 
306 aa  87.4  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0541732 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12277  hypothetical protein  30.34 
 
 
295 aa  85.9  9e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000026926  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1335  hypothetical protein  30.9 
 
 
293 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.402305 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4275  hypothetical protein  31.84 
 
 
289 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0774352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4361  hypothetical protein  31.84 
 
 
289 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0126978 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05730  hypothetical protein  30.42 
 
 
297 aa  76.6  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4303  hypothetical protein  30.9 
 
 
303 aa  76.6  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.670084 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0086  hypothetical protein  35.12 
 
 
278 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4502  hypothetical protein  32.73 
 
 
325 aa  75.5  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.414331  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3967  hypothetical protein  30.98 
 
 
329 aa  74.3  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1165  hypothetical protein  28.22 
 
 
302 aa  74.7  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000066316 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3899  hypothetical protein  35.09 
 
 
289 aa  73.6  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1942  hypothetical protein  33.02 
 
 
357 aa  73.2  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.116952 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4768  protein of unknown function DUF559  33.91 
 
 
259 aa  73.2  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.146214  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1730  hypothetical protein  29.61 
 
 
288 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432935  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3817  hypothetical protein  31.28 
 
 
294 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.590665  normal  0.529394 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13746  hypothetical protein  34.95 
 
 
296 aa  72.4  0.000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00180958  normal  0.465684 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0638  hypothetical protein  34.57 
 
 
284 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0651  hypothetical protein  34.57 
 
 
284 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.617524  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0631  hypothetical protein  34.57 
 
 
284 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0729308 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29770  hypothetical protein  35.87 
 
 
275 aa  72  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0971  hypothetical protein  37.24 
 
 
320 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0989  hypothetical protein  37.24 
 
 
320 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0711273  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0999  hypothetical protein  37.24 
 
 
320 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0096  hypothetical protein  31.28 
 
 
286 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0105  hypothetical protein  31.28 
 
 
286 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13588  hypothetical protein  32.24 
 
 
289 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0436638 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1169  hypothetical protein  26.87 
 
 
320 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1186  hypothetical protein  26.87 
 
 
320 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4733  hypothetical protein  30.3 
 
 
288 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0630614  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4353  hypothetical protein  31.64 
 
 
284 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4439  hypothetical protein  31.64 
 
 
284 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.100384 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1630  hypothetical protein  28.57 
 
 
307 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.121478 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4733  hypothetical protein  31.64 
 
 
284 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.545142  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13550  hypothetical protein  31.32 
 
 
279 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000138397  hitchhiker  0.00000300083 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16880  hypothetical protein  38.46 
 
 
327 aa  67.8  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.38822  normal  0.977824 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4384  hypothetical protein  32.08 
 
 
281 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.88032  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4824  hypothetical protein  37.67 
 
 
295 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2486  hypothetical protein  33.81 
 
 
309 aa  65.9  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.123059  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4153  hypothetical protein  32.08 
 
 
281 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2902  hypothetical protein  28.33 
 
 
319 aa  65.9  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.883902  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4228  hypothetical protein  32.08 
 
 
281 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331823  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5044  hypothetical protein  30.41 
 
 
291 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0991  hypothetical protein  32.64 
 
 
318 aa  64.7  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0912  hypothetical protein  40.31 
 
 
289 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0938391  normal  0.0123481 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1196  hypothetical protein  26.87 
 
 
320 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0446823 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4812  hypothetical protein  29.06 
 
 
307 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00673201 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11091  hypothetical protein  32.52 
 
 
283 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0879835  normal  0.520247 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11511  hypothetical protein  31.84 
 
 
280 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.494625 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4808  hypothetical protein  35.91 
 
 
339 aa  64.7  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1071  hypothetical protein  31.9 
 
 
304 aa  64.3  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3137  hypothetical protein  27.93 
 
 
347 aa  63.5  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4629  hypothetical protein  31.11 
 
 
277 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4717  hypothetical protein  31.11 
 
 
277 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247054  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2611  hypothetical protein  27.9 
 
 
319 aa  62.8  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00285658 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5011  hypothetical protein  27.9 
 
 
277 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.938275  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2812  hypothetical protein  40 
 
 
261 aa  62  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.437661  normal  0.0518068 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0138  hypothetical protein  31.01 
 
 
300 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0147  hypothetical protein  31.01 
 
 
300 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0128  hypothetical protein  31.01 
 
 
300 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5526  hypothetical protein  32.43 
 
 
298 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3163  hypothetical protein  33.33 
 
 
289 aa  60.1  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0735  hypothetical protein  29.51 
 
 
305 aa  60.1  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4443  hypothetical protein  32.97 
 
 
291 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.353827  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4530  hypothetical protein  32.97 
 
 
291 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.724398  normal  0.679375 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1050  hypothetical protein  37.29 
 
 
306 aa  58.9  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0539  hypothetical protein  33.18 
 
 
303 aa  57.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0608  hypothetical protein  28.28 
 
 
290 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.876444  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0621  hypothetical protein  28.28 
 
 
290 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.568124  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0599  hypothetical protein  28.28 
 
 
290 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1289  hypothetical protein  30.46 
 
 
294 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.17962  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0342  hypothetical protein  27.83 
 
 
289 aa  56.2  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.844394  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2384  hypothetical protein  28.73 
 
 
331 aa  55.8  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0898  hypothetical protein  34.21 
 
 
290 aa  55.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28800  hypothetical protein  36.36 
 
 
379 aa  55.1  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5135  hypothetical protein  29.62 
 
 
306 aa  54.7  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3288  hypothetical protein  29.81 
 
 
313 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4722  hypothetical protein  28.08 
 
 
317 aa  54.7  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1237  hypothetical protein  32.78 
 
 
307 aa  55.1  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20280  hypothetical protein  31.88 
 
 
330 aa  54.7  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0497  hypothetical protein  29.51 
 
 
285 aa  55.1  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27230  hypothetical protein  30.1 
 
 
321 aa  54.7  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0302  hypothetical protein  35.54 
 
 
120 aa  54.7  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>