24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0561 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0561  hypothetical protein  100 
 
 
320 aa  629  1e-179  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.273722  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0639  hypothetical protein  52.28 
 
 
201 aa  197  3e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0804  hypothetical protein  37.17 
 
 
318 aa  171  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3709  hypothetical protein  34.62 
 
 
312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4255  hypothetical protein  35.29 
 
 
320 aa  139  6e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0144087  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17370  hypothetical protein  28.17 
 
 
351 aa  80.9  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00299301 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1712  hypothetical protein  35.23 
 
 
237 aa  64.7  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0110448 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1560  hypothetical protein  33.2 
 
 
304 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.426763  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1506  hypothetical protein  31.25 
 
 
306 aa  64.3  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0932  hypothetical protein  28.86 
 
 
355 aa  62.8  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.141741  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2561  hypothetical protein  36.84 
 
 
285 aa  59.3  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.465825  normal  0.0508989 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5265  hypothetical protein  29.33 
 
 
286 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.550058 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2602  hypothetical protein  24.81 
 
 
322 aa  53.1  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.419113  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1580  protein of unknown function DUF559  29.15 
 
 
305 aa  50.1  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1053  protein of unknown function DUF559  37.5 
 
 
270 aa  49.3  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100575  normal  0.261729 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3899  hypothetical protein  32.97 
 
 
289 aa  48.9  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0019  hypothetical protein  25.6 
 
 
313 aa  48.9  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5477  hypothetical protein  31.19 
 
 
285 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0193619  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0898  hypothetical protein  30.36 
 
 
308 aa  47.4  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3303  hypothetical protein  25.68 
 
 
279 aa  46.6  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5155  protein of unknown function DUF559  29.41 
 
 
311 aa  45.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5764  hypothetical protein  30.28 
 
 
285 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2517  hypothetical protein  41.46 
 
 
315 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0780  hypothetical protein  30.16 
 
 
201 aa  43.5  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.600335  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>