89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3520 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3520  hypothetical protein  100 
 
 		 314 aa  642    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.051391  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0955  hypothetical protein  34.33 
 
 		 307 aa  151  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1355  hypothetical protein  31.67 
 
 		 335 aa  125  7e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0634709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0726  hypothetical protein  32.89 
 
 		 310 aa  122  8e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1181  hypothetical protein  34.87 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.59676 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29770  hypothetical protein  33.33 
 
 		 275 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0597  hypothetical protein  31.25 
 
 		 320 aa  109  6e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3354  hypothetical protein  31.54 
 
 		 374 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3137  hypothetical protein  28.99 
 
 		 347 aa  104  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1050  hypothetical protein  33.57 
 
 		 306 aa  99  8e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2158  hypothetical protein  30.23 
 
 		 321 aa  99  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2384  hypothetical protein  28.47 
 
 		 331 aa  98.6  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2364  hypothetical protein  31.65 
 
 		 299 aa  89  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0991  hypothetical protein  29.93 
 
 		 318 aa  89  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3967  hypothetical protein  32.48 
 
 		 329 aa  87.8  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0302  hypothetical protein  46.15 
 
 		 120 aa  84.3  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4303  hypothetical protein  27.55 
 
 		 303 aa  84.7  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.670084 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1339  hypothetical protein  30.74 
 
 		 262 aa  84  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4502  hypothetical protein  28.77 
 
 		 325 aa  80.9  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.414331  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1942  hypothetical protein  30.52 
 
 		 357 aa  79.7  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.116952 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4768  protein of unknown function DUF559  28.46 
 
 		 259 aa  73.6  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.146214  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1976  hypothetical protein  27.47 
 
 		 336 aa  72.4  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000667209 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1723  hypothetical protein  27.37 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0541732 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05730  hypothetical protein  30.04 
 
 		 297 aa  69.3  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0898  hypothetical protein  32.37 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0286  hypothetical protein  28.62 
 
 		 351 aa  65.9  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.141082 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1897  hypothetical protein  27.52 
 
 		 317 aa  65.1  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.221334  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0631  hypothetical protein  28.43 
 
 		 284 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0729308 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31410  hypothetical protein  29.06 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.372839  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0638  hypothetical protein  28.43 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0651  hypothetical protein  28.43 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.617524  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0735  hypothetical protein  26.51 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22240  hypothetical protein  27.27 
 
 		 375 aa  63.5  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.527189  normal  0.11385 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1071  hypothetical protein  26.37 
 
 		 304 aa  62.4  0.000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04430  hypothetical protein  36.36 
 
 		 352 aa  61.2  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.311428  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4808  hypothetical protein  33.33 
 
 		 339 aa  60.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0096  hypothetical protein  25.4 
 
 		 286 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2531  hypothetical protein  28.42 
 
 		 306 aa  58.9  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0105  hypothetical protein  25.4 
 
 		 286 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13588  hypothetical protein  27.35 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0436638 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1953  hypothetical protein  31.43 
 
 		 379 aa  57.4  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000104092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1165  hypothetical protein  26.43 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000066316 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4824  hypothetical protein  33.06 
 
 		 295 aa  57  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4094  hypothetical protein  32.72 
 
 		 339 aa  56.6  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.811217  normal  0.0134077 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4384  hypothetical protein  27.54 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.88032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4153  hypothetical protein  27.54 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4228  hypothetical protein  27.54 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331823  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28800  hypothetical protein  28.44 
 
 		 379 aa  55.8  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3288  hypothetical protein  23.37 
 
 		 313 aa  55.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1630  hypothetical protein  29.73 
 
 		 307 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121478 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3163  hypothetical protein  26.39 
 
 		 289 aa  54.7  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16880  hypothetical protein  37.14 
 
 		 327 aa  54.3  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.38822  normal  0.977824 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0608  hypothetical protein  37 
 
 		 290 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.876444  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0621  hypothetical protein  37 
 
 		 290 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.568124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0599  hypothetical protein  37 
 
 		 290 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1915  hypothetical protein  33.58 
 
 		 297 aa  53.1  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13550  hypothetical protein  26.9 
 
 		 279 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000138397  hitchhiker  0.00000300083 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3121  hypothetical protein  30.3 
 
 		 328 aa  51.2  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.829265  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2535  hypothetical protein  28.39 
 
 		 321 aa  50.8  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3899  hypothetical protein  26.67 
 
 		 289 aa  50.8  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5011  hypothetical protein  25.95 
 
 		 277 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.938275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5044  hypothetical protein  29.41 
 
 		 291 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4629  hypothetical protein  25.95 
 
 		 277 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4717  hypothetical protein  25.95 
 
 		 277 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0217  hypothetical protein  25.73 
 
 		 201 aa  49.7  0.00006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3059  hypothetical protein  30.68 
 
 		 278 aa  49.7  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.169206  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0086  hypothetical protein  26.26 
 
 		 278 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1335  hypothetical protein  28.89 
 
 		 293 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.402305 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0497  hypothetical protein  25.93 
 
 		 285 aa  48.9  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0019  hypothetical protein  24.14 
 
 		 317 aa  48.5  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0256854  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4654  hypothetical protein  25.54 
 
 		 289 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.397587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0971  hypothetical protein  27.47 
 
 		 320 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12277  hypothetical protein  34.17 
 
 		 295 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000026926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0999  hypothetical protein  27.47 
 
 		 320 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0989  hypothetical protein  27.47 
 
 		 320 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0711273  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04300  hypothetical protein  32.82 
 
 		 319 aa  47.8  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.169884  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1742  hypothetical protein  29.44 
 
 		 303 aa  47.8  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11091  hypothetical protein  26.74 
 
 		 283 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0879835  normal  0.520247 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11511  hypothetical protein  25.54 
 
 		 280 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.494625 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3817  hypothetical protein  42.62 
 
 		 294 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.590665  normal  0.529394 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18420  hypothetical protein  32.65 
 
 		 306 aa  45.4  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.056172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1186  hypothetical protein  34.71 
 
 		 320 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1169  hypothetical protein  34.71 
 
 		 320 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4812  hypothetical protein  24 
 
 		 307 aa  44.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00673201 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1692  hypothetical protein  28.83 
 
 		 303 aa  43.9  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.360943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0968  hypothetical protein  26.22 
 
 		 348 aa  43.9  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1196  hypothetical protein  45.45 
 
 		 320 aa  42.7  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0446823 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2812  hypothetical protein  30.71 
 
 		 261 aa  42.7  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.437661  normal  0.0518068 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0342  hypothetical protein  24.26 
 
 		 289 aa  42.4  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.844394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>