90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2812 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2812  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  499  1e-140  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.437661  normal  0.0518068 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2647  hypothetical protein  39.9 
 
 
337 aa  113  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.572191  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4768  protein of unknown function DUF559  41.27 
 
 
259 aa  77  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.146214  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04300  hypothetical protein  35 
 
 
319 aa  63.9  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.169884  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4808  hypothetical protein  34.94 
 
 
339 aa  62.8  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5044  hypothetical protein  34.43 
 
 
291 aa  62.4  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0597  hypothetical protein  33.51 
 
 
320 aa  62  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2158  hypothetical protein  40 
 
 
321 aa  62  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0726  hypothetical protein  33.55 
 
 
310 aa  61.2  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0086  hypothetical protein  32.26 
 
 
278 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0651  hypothetical protein  35.12 
 
 
284 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.617524  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0638  hypothetical protein  35.12 
 
 
284 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0631  hypothetical protein  35.12 
 
 
284 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0729308 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3354  hypothetical protein  32 
 
 
374 aa  57  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20280  hypothetical protein  34.07 
 
 
330 aa  56.2  0.0000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4824  hypothetical protein  34.15 
 
 
295 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2486  hypothetical protein  35.19 
 
 
309 aa  55.8  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.123059  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0898  hypothetical protein  39.88 
 
 
290 aa  55.8  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1942  hypothetical protein  36.47 
 
 
357 aa  55.5  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.116952 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2878  hypothetical protein  37.72 
 
 
302 aa  54.7  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16880  hypothetical protein  35.07 
 
 
327 aa  55.5  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.38822  normal  0.977824 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11511  hypothetical protein  31.21 
 
 
280 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.494625 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13550  hypothetical protein  33.56 
 
 
279 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000138397  hitchhiker  0.00000300083 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1723  hypothetical protein  31.32 
 
 
306 aa  53.5  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0541732 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2535  hypothetical protein  33.76 
 
 
321 aa  53.5  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0096  hypothetical protein  30.97 
 
 
286 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0105  hypothetical protein  30.97 
 
 
286 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2531  hypothetical protein  31.02 
 
 
306 aa  52  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13588  hypothetical protein  41.76 
 
 
289 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0436638 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4094  hypothetical protein  31.02 
 
 
339 aa  52  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.811217  normal  0.0134077 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4733  hypothetical protein  34.91 
 
 
284 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.545142  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4733  hypothetical protein  33.33 
 
 
288 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0630614  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28800  hypothetical protein  34.78 
 
 
379 aa  50.4  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1099  hypothetical protein  33.67 
 
 
306 aa  50.1  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.994405  hitchhiker  0.000237406 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3039  hypothetical protein  29.8 
 
 
289 aa  49.7  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000250216  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1730  hypothetical protein  32.24 
 
 
288 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432935  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05730  hypothetical protein  35.54 
 
 
297 aa  49.3  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1339  hypothetical protein  34.88 
 
 
262 aa  48.9  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334499  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4353  hypothetical protein  34.66 
 
 
284 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2384  hypothetical protein  40.59 
 
 
331 aa  49.3  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3817  hypothetical protein  29.5 
 
 
294 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.590665  normal  0.529394 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4439  hypothetical protein  34.66 
 
 
284 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.100384 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2611  hypothetical protein  29.61 
 
 
319 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00285658 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0955  hypothetical protein  32.9 
 
 
307 aa  48.5  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0138  hypothetical protein  35.96 
 
 
300 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0147  hypothetical protein  35.96 
 
 
300 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0971  hypothetical protein  30.46 
 
 
320 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0927  hypothetical protein  31.98 
 
 
341 aa  47.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3541  hypothetical protein  31.21 
 
 
347 aa  47.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000177029  hitchhiker  0.00855213 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0989  hypothetical protein  30.46 
 
 
320 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0711273  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0128  hypothetical protein  35.96 
 
 
300 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0999  hypothetical protein  30.46 
 
 
320 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0740  hypothetical protein  40.34 
 
 
337 aa  47.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13746  hypothetical protein  30.93 
 
 
296 aa  47  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00180958  normal  0.465684 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1355  hypothetical protein  35.11 
 
 
335 aa  47  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0634709  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1335  hypothetical protein  34.08 
 
 
293 aa  47  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.402305 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3899  hypothetical protein  31.52 
 
 
289 aa  46.6  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5011  hypothetical protein  31.85 
 
 
277 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.938275  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1165  hypothetical protein  27.1 
 
 
302 aa  46.2  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000066316 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4717  hypothetical protein  31.08 
 
 
277 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247054  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4629  hypothetical protein  31.08 
 
 
277 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5526  hypothetical protein  30.52 
 
 
298 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18420  hypothetical protein  31.13 
 
 
306 aa  44.7  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.056172  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5229  hypothetical protein  32.05 
 
 
291 aa  45.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3623  hypothetical protein  30.5 
 
 
293 aa  44.3  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.510989  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0865  hypothetical protein  33.13 
 
 
319 aa  44.3  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0633151  normal  0.194369 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0608  hypothetical protein  30.29 
 
 
290 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.876444  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2902  hypothetical protein  31.65 
 
 
319 aa  44.3  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.883902  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1705  hypothetical protein  30.4 
 
 
1421 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3121  hypothetical protein  33.52 
 
 
328 aa  44.3  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.829265  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2364  hypothetical protein  31.25 
 
 
299 aa  44.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0599  hypothetical protein  30.29 
 
 
290 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22240  hypothetical protein  29.29 
 
 
375 aa  43.9  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.527189  normal  0.11385 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0621  hypothetical protein  30.29 
 
 
290 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.568124  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3163  hypothetical protein  37.17 
 
 
289 aa  43.5  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12277  hypothetical protein  30.72 
 
 
295 aa  43.9  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000026926  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0019  hypothetical protein  28.57 
 
 
317 aa  43.5  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0256854  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0217  hypothetical protein  39.19 
 
 
201 aa  43.1  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1186  hypothetical protein  29.76 
 
 
320 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1169  hypothetical protein  29.76 
 
 
320 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16560  hypothetical protein  33.33 
 
 
325 aa  43.1  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29770  hypothetical protein  31.3 
 
 
275 aa  43.1  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4530  hypothetical protein  32.38 
 
 
291 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.724398  normal  0.679375 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4443  hypothetical protein  32.38 
 
 
291 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.353827  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3520  hypothetical protein  30.71 
 
 
314 aa  42.7  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.051391  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4159  hypothetical protein  28.74 
 
 
276 aa  42.7  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00219007  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4722  hypothetical protein  37.5 
 
 
317 aa  42.4  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2461  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  30.4 
 
 
1403 aa  42.4  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3303  hypothetical protein  30.25 
 
 
279 aa  42.4  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1897  hypothetical protein  47.69 
 
 
317 aa  42  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.221334  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>