132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_18420 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_18420  hypothetical protein  100 
 
 
306 aa  615  1e-175  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.056172  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3288  hypothetical protein  33.82 
 
 
313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1237  hypothetical protein  31.82 
 
 
307 aa  95.9  8e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1165  hypothetical protein  31.9 
 
 
302 aa  95.1  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000066316 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4768  protein of unknown function DUF559  35.16 
 
 
259 aa  94  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.146214  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0086  hypothetical protein  31.74 
 
 
278 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3541  hypothetical protein  31.34 
 
 
347 aa  85.9  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000177029  hitchhiker  0.00855213 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13588  hypothetical protein  32.31 
 
 
289 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0436638 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18620  hypothetical protein  37.37 
 
 
329 aa  83.2  0.000000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.178834  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16560  hypothetical protein  33.2 
 
 
325 aa  81.3  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20280  hypothetical protein  36.16 
 
 
330 aa  80.9  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0638  hypothetical protein  30.3 
 
 
284 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0651  hypothetical protein  30.3 
 
 
284 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.617524  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0631  hypothetical protein  30.3 
 
 
284 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0729308 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5135  hypothetical protein  39.01 
 
 
306 aa  80.1  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0096  hypothetical protein  31.14 
 
 
286 aa  79  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0105  hypothetical protein  31.14 
 
 
286 aa  79  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4722  hypothetical protein  29.61 
 
 
317 aa  77.4  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5044  hypothetical protein  32.14 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2902  hypothetical protein  33.16 
 
 
319 aa  75.1  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.883902  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2611  hypothetical protein  32.18 
 
 
319 aa  75.1  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00285658 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15480  hypothetical protein  32.92 
 
 
335 aa  75.5  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.44382  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21980  hypothetical protein  28.53 
 
 
331 aa  75.5  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0138  hypothetical protein  28.52 
 
 
300 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0147  hypothetical protein  28.52 
 
 
300 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02360  hypothetical protein  33.48 
 
 
310 aa  72.4  0.000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.81063  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5011  hypothetical protein  29.34 
 
 
277 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.938275  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2531  hypothetical protein  28 
 
 
306 aa  72.4  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0128  hypothetical protein  30.86 
 
 
300 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13550  hypothetical protein  28.74 
 
 
279 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000138397  hitchhiker  0.00000300083 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03080  hypothetical protein  30.98 
 
 
313 aa  69.7  0.00000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20040  hypothetical protein  30.62 
 
 
316 aa  69.7  0.00000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0608  hypothetical protein  29.81 
 
 
290 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.876444  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4629  hypothetical protein  28.74 
 
 
277 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0621  hypothetical protein  29.81 
 
 
290 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.568124  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4717  hypothetical protein  28.74 
 
 
277 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247054  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0599  hypothetical protein  29.81 
 
 
290 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0342  hypothetical protein  33.95 
 
 
289 aa  68.9  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.844394  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0019  hypothetical protein  28.3 
 
 
317 aa  68.2  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0256854  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27230  hypothetical protein  34.1 
 
 
321 aa  67.8  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5526  hypothetical protein  33.62 
 
 
298 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1533  hypothetical protein  30.56 
 
 
302 aa  67  0.0000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.837222  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4384  hypothetical protein  30.57 
 
 
281 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.88032  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0955  hypothetical protein  32.89 
 
 
307 aa  65.9  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0191  hypothetical protein  30.16 
 
 
231 aa  65.9  0.0000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3163  hypothetical protein  30.55 
 
 
289 aa  65.9  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4153  hypothetical protein  30.57 
 
 
281 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4228  hypothetical protein  30.57 
 
 
281 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331823  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4812  hypothetical protein  33.13 
 
 
307 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00673201 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5229  hypothetical protein  33.33 
 
 
291 aa  64.7  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4654  hypothetical protein  29.79 
 
 
289 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.397587  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4275  hypothetical protein  29.79 
 
 
289 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0774352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4361  hypothetical protein  29.79 
 
 
289 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0126978 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0898  hypothetical protein  43.18 
 
 
290 aa  63.5  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1723  hypothetical protein  31.97 
 
 
306 aa  62.8  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0541732 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3817  hypothetical protein  34.44 
 
 
294 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.590665  normal  0.529394 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4708  hypothetical protein  29 
 
 
301 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00568624 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4733  hypothetical protein  27.41 
 
 
288 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0630614  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11091  hypothetical protein  29.14 
 
 
283 aa  62  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0879835  normal  0.520247 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11511  hypothetical protein  26.19 
 
 
280 aa  62  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.494625 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01230  hypothetical protein  31.51 
 
 
355 aa  62  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1754  hypothetical protein  31.51 
 
 
299 aa  61.2  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.133696  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0434  hypothetical protein  28.67 
 
 
289 aa  61.6  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1730  hypothetical protein  27.76 
 
 
288 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432935  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1630  hypothetical protein  31.93 
 
 
307 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.121478 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1289  hypothetical protein  32.23 
 
 
294 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.17962  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28800  hypothetical protein  29.76 
 
 
379 aa  58.9  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1339  hypothetical protein  29.96 
 
 
262 aa  58.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334499  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2475  hypothetical protein  27.74 
 
 
277 aa  58.2  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0068  hypothetical protein  26.27 
 
 
276 aa  57.4  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0971  hypothetical protein  27.82 
 
 
320 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0989  hypothetical protein  27.82 
 
 
320 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0711273  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0999  hypothetical protein  27.82 
 
 
320 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1169  hypothetical protein  31.3 
 
 
320 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1186  hypothetical protein  31.3 
 
 
320 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1942  hypothetical protein  27.27 
 
 
357 aa  56.2  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.116952 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13746  hypothetical protein  30.12 
 
 
296 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00180958  normal  0.465684 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1395  hypothetical protein  30.1 
 
 
328 aa  56.2  0.0000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0744184  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4824  hypothetical protein  31.06 
 
 
295 aa  55.8  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2394  hypothetical protein  33.58 
 
 
248 aa  55.8  0.0000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.339824 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12277  hypothetical protein  30.83 
 
 
295 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000026926  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29770  hypothetical protein  33.52 
 
 
275 aa  54.7  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0735  hypothetical protein  35 
 
 
305 aa  53.9  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4443  hypothetical protein  30.28 
 
 
291 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.353827  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4530  hypothetical protein  30.28 
 
 
291 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.724398  normal  0.679375 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1656  hypothetical protein  26.51 
 
 
294 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1355  hypothetical protein  28.28 
 
 
335 aa  53.9  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0634709  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04300  hypothetical protein  33.61 
 
 
319 aa  53.5  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.169884  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1672  hypothetical protein  26.6 
 
 
329 aa  53.5  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.162701  hitchhiker  0.00245023 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1181  hypothetical protein  28.16 
 
 
267 aa  52.8  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.59676 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3039  hypothetical protein  27.87 
 
 
289 aa  52.4  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000250216  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5155  protein of unknown function DUF559  31.33 
 
 
311 aa  51.2  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31410  hypothetical protein  34.31 
 
 
310 aa  50.8  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.372839  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4792  hypothetical protein  28.21 
 
 
294 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.79958  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4808  hypothetical protein  31.97 
 
 
339 aa  50.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31030  hypothetical protein  29.28 
 
 
291 aa  50.4  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0597  hypothetical protein  29.07 
 
 
320 aa  50.1  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16880  hypothetical protein  30.34 
 
 
327 aa  49.7  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.38822  normal  0.977824 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3354  hypothetical protein  29.27 
 
 
374 aa  49.3  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5457  hypothetical protein  30.6 
 
 
301 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.597295 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>