122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1181 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1181  hypothetical protein  100 
 
 
267 aa  533  1e-150  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.59676 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1355  hypothetical protein  55.34 
 
 
335 aa  258  7e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0634709  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0955  hypothetical protein  43.7 
 
 
307 aa  165  8e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0302  hypothetical protein  56.9 
 
 
120 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3520  hypothetical protein  34.87 
 
 
314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.051391  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1050  hypothetical protein  36.9 
 
 
306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0991  hypothetical protein  37.93 
 
 
318 aa  117  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3967  hypothetical protein  37.24 
 
 
329 aa  111  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4502  hypothetical protein  37.07 
 
 
325 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.414331  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3137  hypothetical protein  36.12 
 
 
347 aa  108  7.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4808  hypothetical protein  39.57 
 
 
339 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0735  hypothetical protein  36.4 
 
 
305 aa  105  6e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1339  hypothetical protein  36.02 
 
 
262 aa  104  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334499  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4303  hypothetical protein  34.26 
 
 
303 aa  99  7e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.670084 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0597  hypothetical protein  31.62 
 
 
320 aa  97.8  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2158  hypothetical protein  36.41 
 
 
321 aa  96.7  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3354  hypothetical protein  32.91 
 
 
374 aa  95.1  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2531  hypothetical protein  32.53 
 
 
306 aa  91.7  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0726  hypothetical protein  30.9 
 
 
310 aa  89.4  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11511  hypothetical protein  33.86 
 
 
280 aa  88.6  9e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.494625 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12277  hypothetical protein  36 
 
 
295 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000026926  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0342  hypothetical protein  31.72 
 
 
289 aa  85.9  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.844394  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29770  hypothetical protein  35.56 
 
 
275 aa  84.7  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2364  hypothetical protein  37.7 
 
 
299 aa  84.7  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0096  hypothetical protein  30.43 
 
 
286 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0105  hypothetical protein  30.43 
 
 
286 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0086  hypothetical protein  32.31 
 
 
278 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0608  hypothetical protein  30.84 
 
 
290 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.876444  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0621  hypothetical protein  30.84 
 
 
290 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.568124  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0599  hypothetical protein  30.84 
 
 
290 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0286  hypothetical protein  28.95 
 
 
351 aa  80.5  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.141082 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3059  hypothetical protein  33.91 
 
 
278 aa  80.1  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.169206  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5011  hypothetical protein  29.71 
 
 
277 aa  79  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.938275  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1071  hypothetical protein  34.71 
 
 
304 aa  79  0.00000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13550  hypothetical protein  33.47 
 
 
279 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000138397  hitchhiker  0.00000300083 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1723  hypothetical protein  31.14 
 
 
306 aa  76.6  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0541732 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3288  hypothetical protein  31.05 
 
 
313 aa  75.9  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4629  hypothetical protein  29.29 
 
 
277 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2384  hypothetical protein  31.78 
 
 
331 aa  74.7  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4717  hypothetical protein  29.29 
 
 
277 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247054  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1942  hypothetical protein  32.94 
 
 
357 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.116952 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0631  hypothetical protein  30.99 
 
 
284 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0729308 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0638  hypothetical protein  30.99 
 
 
284 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0651  hypothetical protein  30.99 
 
 
284 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.617524  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1289  hypothetical protein  29.66 
 
 
294 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.17962  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5526  hypothetical protein  30.57 
 
 
298 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4824  hypothetical protein  31.75 
 
 
295 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04430  hypothetical protein  38.37 
 
 
352 aa  68.6  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.311428  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1169  hypothetical protein  31.76 
 
 
320 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1186  hypothetical protein  31.76 
 
 
320 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1335  hypothetical protein  37.07 
 
 
293 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.402305 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5044  hypothetical protein  27.45 
 
 
291 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5457  hypothetical protein  31.98 
 
 
301 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.597295 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4768  protein of unknown function DUF559  28.51 
 
 
259 aa  67  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.146214  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0971  hypothetical protein  29.61 
 
 
320 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0989  hypothetical protein  29.61 
 
 
320 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0711273  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0999  hypothetical protein  29.61 
 
 
320 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3039  hypothetical protein  29.44 
 
 
289 aa  65.5  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000250216  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4275  hypothetical protein  32.11 
 
 
289 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0774352  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4353  hypothetical protein  34.55 
 
 
284 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4361  hypothetical protein  32.11 
 
 
289 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0126978 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4439  hypothetical protein  34.55 
 
 
284 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.100384 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4733  hypothetical protein  34.55 
 
 
284 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.545142  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4733  hypothetical protein  30.61 
 
 
288 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0630614  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18620  hypothetical protein  30.63 
 
 
329 aa  63.9  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.178834  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16880  hypothetical protein  33.82 
 
 
327 aa  64.3  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.38822  normal  0.977824 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1730  hypothetical protein  28.14 
 
 
288 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432935  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4384  hypothetical protein  30.11 
 
 
281 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.88032  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4654  hypothetical protein  31.91 
 
 
289 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.397587  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2535  hypothetical protein  31.16 
 
 
321 aa  63.5  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15480  hypothetical protein  30.47 
 
 
335 aa  63.2  0.000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.44382  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4153  hypothetical protein  30.9 
 
 
281 aa  62.4  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4228  hypothetical protein  30.9 
 
 
281 aa  62.4  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331823  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0138  hypothetical protein  30.6 
 
 
300 aa  62.4  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0147  hypothetical protein  30.6 
 
 
300 aa  62.4  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1630  hypothetical protein  31.38 
 
 
307 aa  62.4  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.121478 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0128  hypothetical protein  30.6 
 
 
300 aa  62  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2902  hypothetical protein  28.52 
 
 
319 aa  62  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.883902  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1196  hypothetical protein  34.78 
 
 
320 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0446823 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31410  hypothetical protein  32.3 
 
 
310 aa  62  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.372839  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05730  hypothetical protein  28.4 
 
 
297 aa  60.8  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13746  hypothetical protein  30.99 
 
 
296 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00180958  normal  0.465684 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0912  hypothetical protein  28.26 
 
 
289 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0938391  normal  0.0123481 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1165  hypothetical protein  26.48 
 
 
302 aa  59.7  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000066316 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11091  hypothetical protein  27.6 
 
 
283 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0879835  normal  0.520247 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4443  hypothetical protein  31 
 
 
291 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.353827  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3121  hypothetical protein  30.17 
 
 
328 aa  58.5  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.829265  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4530  hypothetical protein  31 
 
 
291 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.724398  normal  0.679375 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0898  hypothetical protein  37.89 
 
 
290 aa  56.6  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4812  hypothetical protein  27.54 
 
 
307 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00673201 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2611  hypothetical protein  26.64 
 
 
319 aa  55.8  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00285658 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0740  hypothetical protein  33.71 
 
 
337 aa  55.8  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13588  hypothetical protein  27.69 
 
 
289 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0436638 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3007  hypothetical protein  30.47 
 
 
424 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.153123  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1506  hypothetical protein  30.73 
 
 
306 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0927  hypothetical protein  31.47 
 
 
341 aa  54.7  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1976  hypothetical protein  29.2 
 
 
336 aa  54.7  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000667209 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4094  hypothetical protein  34.86 
 
 
339 aa  54.3  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.811217  normal  0.0134077 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18420  hypothetical protein  28.16 
 
 
306 aa  52.8  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.056172  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3899  hypothetical protein  29.67 
 
 
289 aa  52  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>