17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1233 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1233  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  313  4e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0114459  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2841  protein of unknown function DUF559  46.03 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00016732  normal  0.493476 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5265  hypothetical protein  36.11 
 
 		 286 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.550058 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4375  hypothetical protein  36 
 
 		 335 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0453814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0625  hypothetical protein  36 
 
 		 335 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.192003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5155  protein of unknown function DUF559  37.68 
 
 		 311 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3848  hypothetical protein  38.36 
 
 		 143 aa  48.9  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0110186  normal  0.347936 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2277  hypothetical protein  26.77 
 
 		 257 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110769  hitchhiker  0.0000150727 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3899  hypothetical protein  32.89 
 
 		 289 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5477  hypothetical protein  34.57 
 
 		 285 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0193619  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5764  hypothetical protein  34.57 
 
 		 285 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5388  hypothetical protein  34.57 
 
 		 242 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4768  protein of unknown function DUF559  40.62 
 
 		 259 aa  44.3  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.146214  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3303  hypothetical protein  33.8 
 
 		 279 aa  43.5  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1560  hypothetical protein  32.91 
 
 		 304 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.426763  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3817  hypothetical protein  26.77 
 
 		 294 aa  41.2  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.590665  normal  0.529394 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1827  hypothetical protein  29.87 
 
 		 331 aa  40.4  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.14041  normal  0.116038 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>